当前蛋白身份：P83476
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2N9T NMR solution structure of ProTx-II 提交 2015-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–30（30 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；压力 ambient
NMR样品组成
2 mg protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mg protein, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5O0U Crystal structure of tarantula venom peptide Protoxin-II 提交 2017-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–30（30 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2M lithium sulfate, 100 mM Tris-HCl (pH 8), 2% v/v PEG 400
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.140 |
| 6MK4 Solution NMR structure of spider toxin analogue [E17K]ProTx-II 提交 2018-09-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–30（30 aa）
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突变：E17K | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
2 mg/mL [E17K]ProTx-II, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6N4I Structural basis of Nav1.7 inhibition by a gating-modifier spider toxin 提交 2018-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
1–30（30 aa）
链 F
1–30（30 aa）
链 G
1–30（30 aa）
链 H
1–30（30 aa）
|
未记录 | 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2.3-2.6M Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.0; 30% sucrose for cryo
|
分辨率 3.54 Å R-free 0.294 |
| 6N4Q CryoEM structure of Nav1.7 VSD2 (actived state) in complex with the gating modifier toxin ProTx2 提交 2018-11-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
1–30（30 aa）
链 F
1–30（30 aa）
链 G
1–30（30 aa）
链 H
1–30（30 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；10 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 0.06% FA3, 0.1 mg/ml POPC:POPE:POPG mixed at molar ratio 3:1:1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Apply 3 uL, blot 2.5s. Ted Pella 595 filter paper.
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分辨率 3.60 Å |
| 6N4R CryoEM structure of Nav1.7 VSD2 (deactived state) in complex with the gating modifier toxin ProTx2 提交 2018-11-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
1–30（30 aa）
链 F
1–30（30 aa）
链 G
1–30（30 aa）
链 H
1–30（30 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；10 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 0.06% FA3, 0.1 mg/ml POPC:POPE:POPG mixed at molar ratio 3:1:1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Apply 3 uL, blot 2.5s. Ted Pella 595 filter paper.
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分辨率 4.20 Å |