当前蛋白身份：P83916
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2FMM Crystal Structure of EMSY-HP1 complex 提交 2006-01-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
104–175（72 aa）
片段：CHROMO SHADOW DOMAIN
链 B
104–175（72 aa）
片段：CHROMO SHADOW DOMAIN
链 C
104–175（72 aa）
片段：CHROMO SHADOW DOMAIN
链 D
104–175（72 aa）
片段：CHROMO SHADOW DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 3F2U Crystal structure of human chromobox homolog 1 (CBX1) 提交 2008-10-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–73（54 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；30% PEG 400, 0.2M CaCl2 0.1M Na Hepes 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.274 |
| 3Q6S The crystal structure of the heterochromatin protein 1 beta chromoshadow domain complexed with a peptide from Shugoshin 1 提交 2011-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
108–185（78 aa）
片段：chromoshadow domain, residues 108-185
链 D
108–185（78 aa）
片段：chromoshadow domain, residues 108-185
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.6；293 K；0.1 M Bis-tris, 0.2 M NaCl, 21% (w/v) PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.229 |
| 3Q6S The crystal structure of the heterochromatin protein 1 beta chromoshadow domain complexed with a peptide from Shugoshin 1 提交 2011-01-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
108–185（78 aa）
片段：chromoshadow domain, residues 108-185
链 C
108–185（78 aa）
片段：chromoshadow domain, residues 108-185
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.6；293 K；0.1 M Bis-tris, 0.2 M NaCl, 21% (w/v) PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.229 |
| 5T1G chromo shadow domain of CBX1 in complex with a histone peptide 提交 2016-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
108–185（78 aa）
片段：unp residues 108-185
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.5 M sodium citrate, 0.1 M HEPES
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分辨率 1.90 Å R-free 0.243 |
| 6D07 Crystal structure of the complex between human chromobox homolog 1 (CBX1) and H3K9me3 peptide 提交 2018-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–73（54 aa）
片段：UNP residues 20-73
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0, 30% w/v PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 6D07 Crystal structure of the complex between human chromobox homolog 1 (CBX1) and H3K9me3 peptide 提交 2018-04-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–73（54 aa）
片段：UNP residues 20-73
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0, 30% w/v PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 6D08 Crystal structure of an engineered bump-hole complex of mutant human chromobox homolog 1 (CBX1) with H3K9bn peptide 提交 2018-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–73（54 aa）
片段：UNP residues 20-73
|
突变：Y3F, F27G | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M citrate, pH 5.0, 3 M ammonium sulfate
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分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |
| 6D08 Crystal structure of an engineered bump-hole complex of mutant human chromobox homolog 1 (CBX1) with H3K9bn peptide 提交 2018-04-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
20–73（54 aa）
片段：UNP residues 20-73
|
突变：Y3F, F27G | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M citrate, pH 5.0, 3 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |