当前蛋白身份：P97333
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10RI Dimeric complex of VEGF, VEGFR2 and Neuropilin 1 提交 2026-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
22–855（834 aa）
链 F
22–855（834 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.60 Å |
| 10RJ Heparin-induced cis tetrameric complex of VEGF, VEGFR2 and Neuropilin 1 提交 2026-02-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
22–855（834 aa）
链 F
22–855（834 aa）
链 K
22–855（834 aa）
链 L
22–855（834 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.34 Å |
| 10RK Heparin-induced trans tetrameric complex of VEGF, VEGFR2 and Neuropilin 1 提交 2026-02-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
22–855（834 aa）
链 F
22–855（834 aa）
链 K
22–855（834 aa）
链 L
22–855（834 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.65 Å |
| 4GZ9 Mouse Neuropilin-1, extracellular domains 1-4 (a1a2b1b2) 提交 2012-09-06 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–586（565 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-586
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 1.5M lithium sulphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4GZ9 Mouse Neuropilin-1, extracellular domains 1-4 (a1a2b1b2) 提交 2012-09-06 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–586（565 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-586
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 1.5M lithium sulphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4GZA Complex of mouse Plexin A2 - Semaphorin 3A - Neuropilin-1 提交 2012-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 H
22–586（565 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-586
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；70mM HEPES, pH 7.5, 1.4% w/v PEG 400, 12% v/v glycerol, 1.4M ammonium sulphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；70mM HEPES, pH 7.5, 1.4% w/v PEG 400, 12% v/v glycerol, 1.4M ammonium sulphate, 1% v/v ethyl acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；70mM HEPES, pH 7.5, 1.4% w/v PEG 400, 12% v/v glycerol, 1.4M ammonium sulphate, 8% v/v acetonitrile , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 7.00 Å R-free 0.285 |
| 7M0R Cryo-EM structure of the Sema3A/PlexinA4/Neuropilin 1 complex 提交 2021-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
22–588（567 aa）
链 F
22–588（567 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |