当前蛋白身份：P97798
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4BQ6 Crystal structure of the RGMB-NEO1 complex form 1 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5 0.2 M SODIUM ACETATE 30% PEG4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 4BQ6 Crystal structure of the RGMB-NEO1 complex form 1 提交 2013-05-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5 0.2 M SODIUM ACETATE 30% PEG4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 4BQ7 Crystal structure of the RGMB-Neo1 complex form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2 M LITHIUM SULPHATE, 25 % PEG3350
|
分辨率 6.60 Å R-free 0.280 |
| 4BQ7 Crystal structure of the RGMB-Neo1 complex form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2 M LITHIUM SULPHATE, 25 % PEG3350
|
分辨率 6.60 Å R-free 0.280 |
| 4BQ8 Crystal structure of the RGMB-NEO1 complex form 3 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1083（201 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1083
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；0.1 M SODIUM ACETATE, PH 4.6, 0.18 M POTASSIUM ACETATE, 18 % PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.199 |
| 4BQ9 Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 1 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1083（201 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1083
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2 M SODIUM ACETATE, 30% PEG4000
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.230 |
| 4BQ9 Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 1 提交 2013-05-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
883–1083（201 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1083
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2 M SODIUM ACETATE, 30% PEG4000
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.230 |
| 4BQB Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.13 M POTASSIUM NITRATE, 13% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4BQB Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.13 M POTASSIUM NITRATE, 13% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4BQB Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.13 M POTASSIUM NITRATE, 13% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4BQB Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1, form 2 提交 2013-05-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.13 M POTASSIUM NITRATE, 13% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 4BQC Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1 bound to SOS 提交 2013-05-30 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.15 M POTASSIUM NITRATE, 15% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.259 |
| 4BQC Crystal structure of the FN5 and FN6 domains of NEO1 bound to SOS 提交 2013-05-30 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
883–1133（251 aa）
片段：FN-TYPE III DOMAINS 5 AND 6, RESIDUES 883-1133
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.15 M POTASSIUM NITRATE, 15% PEG3350, pH 8.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.259 |
| 4PLN Crystal Structure of Chicken Netrin-1 (LN-LE3) complexed with mouse Neogenin (FN4-5) 提交 2014-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
765–964（200 aa）
片段：FN4-5 (UNP residues 765-964)
链 D
765–964（200 aa）
片段：FN4-5 (UNP residues 765-964)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M Hepes pH 7.0, 12% PEG3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.239 |
| 4UI2 Crystal structure of the ternary RGMB-BMP2-NEO1 complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
883–1133（251 aa）
片段：5TH AND 6TH FN TYPE 3 LIKE DOMAINS
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未记录 | SRT S,R MESO-TARTARIC ACID × 6 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 1.5 M AMMONIUM SULPHATE, 12% (V/V) GLYCEROL
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.236 |
| 6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 E
883–1123（241 aa）
链 F
883–1123（241 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.428 |
| 6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 K
883–1123（241 aa）
链 L
883–1123（241 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.428 |
| 6Z3M Repulsive Guidance Molecule B (RGMB) in complex with Growth Differentiation Factor 5 (GDF5) and Neogenin 1 (NEO1). 提交 2020-05-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 Q
883–1123（241 aa）
链 R
883–1123（241 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M NaCl, 20 mM MES pH 6.7, 6.6% w/v PEG 4000
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.428 |