当前蛋白身份:P97924
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1U3O Solution structure of rat Kalirin N-terminal SH3 domain 提交 2004-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1637–1706(70 aa)
片段:SH3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200 mM;压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM U-15N protein, 50 mM HEPES, 150 mM NaCl, 1 mM dithiotheitol, 92.5% H2O, 7.5% D2O | 92.5% H2O, 7.5% D2O
NMR样品组成
1 mM U-15N,13C protein, 50 mM HEPES, 150 mM NaCl, 1 mM dithiotheitol, 92.5% H2O, 7.5% D2O | 92.5% H2O, 7.5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KR9 Kalirin DH1 NMR structure 提交 2009-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1253–1432(180 aa)
片段:DH 1 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298.15 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 1.00
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KalDH1, 50.0 mM Hepes, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.56 mM [U-100% 15N] KalDH1, 50.00 mM Hepes, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5O33 A structure of the GEF Kalirin DH1 domain in complex with the small GTPase Rac1 提交 2017-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1432(180 aa)
片段:UNP residues 1253-1432
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M citrate pH4.2, 0.2M sodium chloride, 18% (W/V) PEG 8000
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分辨率 1.64 Å R-free 0.240 |
| 9HU8 Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with MC-278. 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1432(180 aa)
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未记录 | A1IXV 2-chloranyl-~{N}-(2-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-1~{H}-1,8-naphthyridin-4-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M citrate pH 4.2, 0.2 M NaCl and 18 % PEG 8K
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分辨率 1.48 Å R-free 0.231 |
| 9I1L Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with RS-009 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1432(180 aa)
片段:UNP residues 1253-1432
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未记录 | A1IZQ 2-chloranyl-~{N}-(6-oxidanylidene-1,7-dihydropyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)ethanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M bis-tris pH 5.5, 0.1 M NaCl,
27% PEG 3350
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.269 |
| 9IFK Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with DK-2 提交 2025-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1432(180 aa)
片段:UNP residues 1253-1432
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未记录 | A1I32 2-chloranyl-~{N}-(2-oxidanylidene-1~{H}-quinolin-4-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M citrate pH 4.7, 0.8 M LiCl and
25% PEG 6K.
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分辨率 1.34 Å R-free 0.235 |
| 9IG1 Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with DK-652 提交 2025-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1432(180 aa)
片段:UNP residues 1253-1432
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未记录 | A1I33 2-chloranyl-~{N}-(1-oxidanylidene-2~{H}-isoquinolin-7-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M bis-tris pH 5.5, 0.2 M NaCl and
25% PEG 3350
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分辨率 1.65 Å R-free 0.293 |