当前蛋白身份:P98073 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4DGJ Structure of a human enteropeptidase light chain variant 提交 2012-01-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 785–1019(235 aa)
突变:N6D, G21D, G22D, C112S, N142D, K210E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;292 K;0.1 M HEPES, 16% PEG 10000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
4DGJ Structure of a human enteropeptidase light chain variant 提交 2012-01-26 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 785–1019(235 aa)
突变:N6D, G21D, G22D, C112S, N142D, K210E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;292 K;0.1 M HEPES, 16% PEG 10000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
4DGJ Structure of a human enteropeptidase light chain variant 提交 2012-01-26 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 785–1019(235 aa)
突变:N6D, G21D, G22D, C112S, N142D, K210E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;292 K;0.1 M HEPES, 16% PEG 10000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
4DGJ Structure of a human enteropeptidase light chain variant 提交 2012-01-26 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 785–1019(235 aa)
突变:N6D, G21D, G22D, C112S, N142D, K210E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;292 K;0.1 M HEPES, 16% PEG 10000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
6ZOV ENTEROPEPTIDASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2020-07-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 785–1019(235 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
未记录 GBS 4-carbamimidamidobenzoic acid × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;293 K;PEG20000
分辨率 2.19 Å R-free 0.250
6ZOV ENTEROPEPTIDASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2020-07-07 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 785–1019(235 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
未记录 GBS 4-carbamimidamidobenzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;293 K;PEG20000
分辨率 2.19 Å R-free 0.250
6ZOV ENTEROPEPTIDASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2020-07-07 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 785–1019(235 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
未记录 GBS 4-carbamimidamidobenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;293 K;PEG20000
分辨率 2.19 Å R-free 0.250
6ZOV ENTEROPEPTIDASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2020-07-07 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 785–1019(235 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
未记录 GBS 4-carbamimidamidobenzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.25;293 K;PEG20000
分辨率 2.19 Å R-free 0.250
7WQW Structure of Active-EP 提交 2022-01-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 524–784(261 aa)
链 B 785–1019(235 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7WQX Structure of Inactive-EP 提交 2022-01-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 519–1019(501 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7WQZ Structure of Active-mutEP 提交 2022-01-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 524–784(261 aa)
链 B 785–1019(235 aa)
突变:H825A, D876A, S971A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7WR7 Structure of Inhibited-EP 提交 2022-01-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 524–784(261 aa)
链 B 785–1019(235 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 GBS 4-carbamimidamidobenzoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8H3S Substrate-bound EP, polyA model 提交 2022-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 183–784(602 aa)
链 B 785–1019(235 aa)
突变:H825A, D876A, S971A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8H3U Inhibitor-bound EP, polyA model 提交 2022-10-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 183–784(602 aa)
链 B 785–1019(235 aa)
突变:H825A,D876A,S971A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8ZI4 Cryo-EM structure of wtEP-trypsinogen 提交 2024-05-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 182–784(603 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:H825A/D876A/S971A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8ZIV wtEP-trypsinogen in Tryp-1 提交 2024-05-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 182–784(603 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:H825A/D876A/S971A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8ZIW enteropeptidase with E574A 提交 2024-05-14 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 501–784(284 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:E574A 突变:H825A/D876A/S971A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8ZIY trypsinogen-EP-E574A 提交 2024-05-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 182–784(603 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:E574A 突变:H825A/D876A/S971A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8ZIZ enteropeptidase with N619A 提交 2024-05-14 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 509–784(276 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:N619A 突变:H825A/D876A/S971A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8ZJ4 trypsinogen-EP-N619A 提交 2024-05-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 182–784(603 aa)
链 D 785–1019(235 aa)
突变:N619A 突变:H825A/D876A/S971A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å