当前蛋白身份:P9WGH5 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–177(177 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;295 K;100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–177(177 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;295 K;100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 6nt spacer 提交 2018-06-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–177(177 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.30 Å R-free 0.235
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 F 1–177(177 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;295 K;100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 F 1–177(177 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;295 K;100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248