当前蛋白身份:P9WGH9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;295 K;0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.256
6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–95(95 aa) 片段:UNP residues 1-95, UNP residues 150-188, UNP residues 144-216
链 F 144–216(73 aa) 片段:UNP residues 1-95, UNP residues 150-188, UNP residues 144-216
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
分辨率 3.11 Å R-free 0.238
6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 F 1–216(216 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 3.35 Å R-free 0.260