当前蛋白身份：Q000H7
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3OQ7 Crystal Structures of Multidrug-Resistant Clinical Isolate 769 HIV-1 Protease Variants 提交 2010-09-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.3-1.0M sodium chloride in the pH range 5.5-7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.223 |
| 3OQA Crystal Structures of Multidrug-Resistant Clinical Isolate 769 HIV-1 Protease Variants 提交 2010-09-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
|
突变：T82S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.3-1.0M sodium chloride in the pH range 5.5-7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.238 |
| 3OQD Crystal Structures of Multidrug-Resistant Clinical Isolate 769 HIV-1 Protease Variants 提交 2010-09-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
|
突变：T82F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.3-1.0M sodium chloride in the pH range 5.5-7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.229 |
| 3OTY MDR769 HIV-1 protease complexed with RT/RH hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
01 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.236 |
| 3OU1 MDR769 HIV-1 protease complexed with RH/IN hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
01 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 3OU3 MDR769 HIV-1 protease complexed with PR/RT hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
01 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 3OU4 MDR769 HIV-1 protease complexed with TF/PR hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
01 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 3OUA MDR769 HIV-1 protease complexed with p1/p6 hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
01 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 3OUB MDR769 HIV-1 protease complexed with NC/p1 hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
0.1 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.236 |
| 3OUC MDR769 HIV-1 protease complexed with p2/NC hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
0.1 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 3OUD MDR769 HIV-1 protease complexed with CA/p2 hepta-peptide 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；0.8M NaCl
0.1 M MES
, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 3PJ6 Crystal Structures of Multidrug-Resistant Clinical Isolate 769 HIV-1 Protease Variants 提交 2010-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；300 K；0.3-1.0 M NaCl, pH 5.5-7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.304 |
| 3R0W Crystal Structures of Multidrug-resistant HIV-1 Protease in Complex with Mechanism-Based Aspartyl Protease Inhibitors. 提交 2011-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | RSY N-[(2R)-1-{[(2S,3S)-5-{[(2R)-1-{[(2S)-1-amino-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino}-3-chloro-1-oxopropan-2-yl]amino}-3-hydroxy-5-oxo-1-phenylpentan-2-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；0.3 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.245 |
| 3R0Y Crystal Structures of Multidrug-resistant HIV-1 Protease in Complex with Mechanism-Based Aspartyl Protease Inhibitors 提交 2011-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | RSZ N-[(2S)-1-{[(2S,3S)-3-hydroxy-5-oxo-5-{[(2R)-1-oxo-3-phenyl-1-(prop-2-yn-1-ylamino)propan-2-yl]amino}-1-phenylpentan-2-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；0.3 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.231 |
| 3SO9 Darunavir in Complex with a Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease Variant 提交 2011-06-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：HIV-1 protease, UNP residues 1-99
链 B
1–99（99 aa）
片段：HIV-1 protease, UNP residues 1-99
|
突变：Q7K, L10I, M36V, M46L, I54V, I62V, L63P, A71V, V82T, I84V, L90M 突变：Q7K, L10I, M36V, M46L, I54V, I62V, L63P, A71V, V82T, I84V, L90M | 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1M MES and 2.4M ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.256 |
| 3SPK Tipranavir in Complex with a Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease Variant 提交 2011-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：HIV-1 protease
链 B
1–99（99 aa）
片段：HIV-1 protease
|
突变：Q7K, L10I, M36V, M46L, I54V, I62V, L63P, A71V, V82T, I84V, L90M 突变：Q7K, L10I, M36V, M46L, I54V, I62V, L63P, A71V, V82T, I84V, L90M | TPV N-(3-{(1R)-1-[(6R)-4-HYDROXY-2-OXO-6-PHENETHYL-6-PROPYL-5,6-DIHYDRO-2H-PYRAN-3-YL]PROPYL}PHENYL)-5-(TRIFLUOROMETHYL)-2-PYRIDINESULFONAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1M MES and 2.4M ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.227 |
| 4EYR Crystal structure of multidrug-resistant clinical isolate 769 HIV-1 protease in complex with ritonavir 提交 2012-05-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
链 B
1–99（99 aa）
片段：UNP residues 1-99
|
未记录 | RIT RITONAVIR × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；0.8M NaCl, 0.1 M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.226 |
| 4FAE Substrate p2/NC in Complex with a Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease Variant 提交 2012-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
突变：D25N, D35E, I36V, M46L 突变：D25N, D35E, I36V, M46L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；0.1 M citric acid, 2.4 M ammonium sulfate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4FAF Substrate CA/p2 in Complex with a Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease Variant 提交 2012-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
突变：D25N, D35E, I36V, M46L 突变：D25N, D35E, I36V, M46L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M MES, 2.4 M ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 4L1A Crystallographic study of multi-drug resistant HIV-1 protease Lopinavir complex: mechanism of drug recognition and resistance 提交 2013-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | AB1 N-{1-BENZYL-4-[2-(2,6-DIMETHYL-PHENOXY)-ACETYLAMINO]-3-HYDROXY-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(2-OXO-TETRAHYDRO-PYRIMIDIN-1-YL)-BUTYRAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；The hanging drop vapor diffusion method was used to form the bipyramidal crystals of the MDR 769 protease. Using a grid screen consisting of sodium chloride (0.7 to 1.4 M) and MES-HEPES buffer (pH 5.5 to 8.1), the HIV-1 protease substrate complex crystals formed overnight at 22 C. Routinely, 0.2 mm crystals, in the longest dimension, were obtained after 14 days of incubation. In each well, there were two droplets, containing 1 lL of protease substrate mixture, 1 lL of reservoir solution and 2 lL of protease substrate mixture, 1 lL of reservoir solution, respectively, 07 mL of well solution., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.260 |
| 4NKK Crystal structure of a multi-drug resistant clinical isolate-769 HIV-1 protease variant that is resistant to the dimerization inhibitory activity of TLF-PafF 提交 2013-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；0.3-1.0 M NaCl (precipitant), pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |