当前蛋白身份：Q00610
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2XZG Clathrin Terminal Domain Complexed with Pitstop 1 提交 2010-11-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-364
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 VH1 2-(4-AMINOBENZYL)-1,3-DIOXO-2,3-DIHYDRO-1H-BENZO[DE]ISOQUINOLINE-5-SULFONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；20% PEG 3350, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 0.1 M TRIS, PH 8.0.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 4G55 Clathrin terminal domain complexed with pitstop 2 提交 2012-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 VH2 N-[5-[(4-BROMOPHENYL)METHYL]-4-HYDROXY-1,3-THIAZOL-2-YL]NAPHTHALENE-1-SULFONAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 0.1 M TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.215 |
| 6E4L The structure of the N-terminal domain of human clathrin heavy chain 1 (nTD) in complex with ES9 提交 2018-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 3 HRS 5-bromo-N-(4-nitrophenyl)thiophene-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 0.1 M TRIS, pH 8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.214 |
| 6QNN CLATHRIN HEAVY CHAIN N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO GTSE1 LIDL MOTIF 提交 2019-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
片段：;LIDL motifs A-E, REFSEQ RESIDUES 661-726, N-TERMINAL 'GPLG' ARE NON-NATURAL
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；20% PEG 6000, 0.1M TRIS pH 8.0
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.284 |
| 6QNP CLATHRIN HEAVY CHAIN N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO GTSE1 LIDL MOTIF 提交 2019-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
片段：;LIDL motifs A-D, REFSEQ RESIDUES 653-719, N-TERMINAL 'GPLGS' ARE NON-NATURAL
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；12% PEG 4000, 0.1M SODIUM ACETATE, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |
| 6QNP CLATHRIN HEAVY CHAIN N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO GTSE1 LIDL MOTIF 提交 2019-02-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
片段：;LIDL motifs A-D, REFSEQ RESIDUES 653-719, N-TERMINAL 'GPLGS' ARE NON-NATURAL
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；12% PEG 4000, 0.1M SODIUM ACETATE, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |
| 6QNP CLATHRIN HEAVY CHAIN N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO GTSE1 LIDL MOTIF 提交 2019-02-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–364（364 aa）
片段：;LIDL motifs A-D, REFSEQ RESIDUES 653-719, N-TERMINAL 'GPLGS' ARE NON-NATURAL
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；12% PEG 4000, 0.1M SODIUM ACETATE, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |
| 6QNP CLATHRIN HEAVY CHAIN N-TERMINAL DOMAIN BOUND TO GTSE1 LIDL MOTIF 提交 2019-02-11 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–364（364 aa）
片段：;LIDL motifs A-D, REFSEQ RESIDUES 653-719, N-TERMINAL 'GPLGS' ARE NON-NATURAL
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；12% PEG 4000, 0.1M SODIUM ACETATE, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |
| 7BN1 Clathrin heavy chain N-terminal domain complexed with peptide from Protein mu-NS of Reovirus type 1 提交 2021-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；30% PEG 550 MME; PEG 20K, 0.12M Monosaccharides (D-Glucose; D-Mannose; D-Galactose; L-Fucose; D-Xylose; N-Acetyl-D-Glucosamine) and 0.1M Sodium HEPES; MOPS (acid) pH-7.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.215 |
| 7BN1 Clathrin heavy chain N-terminal domain complexed with peptide from Protein mu-NS of Reovirus type 1 提交 2021-01-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；30% PEG 550 MME; PEG 20K, 0.12M Monosaccharides (D-Glucose; D-Mannose; D-Galactose; L-Fucose; D-Xylose; N-Acetyl-D-Glucosamine) and 0.1M Sodium HEPES; MOPS (acid) pH-7.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.215 |
| 7BN2 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to Non structured protein 3 from Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2021-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
1–364（364 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；30% PEG 550 MME; PEG 20K and 0.1M NPS buffer system NaN03; Na2HPO4; (NH4)2SO4, pH-6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.219 |
| 7BN2 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to Non structured protein 3 from Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2021-01-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 BBB
1–364（364 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；30% PEG 550 MME; PEG 20K and 0.1M NPS buffer system NaN03; Na2HPO4; (NH4)2SO4, pH-6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.219 |
| 7ZX4 Clathrin N-terminal domain in complex with a HURP phospho-peptide 提交 2022-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；50 mM Tris pH 7.5, 30 % PEG 6000
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.249 |
| 7ZX4 Clathrin N-terminal domain in complex with a HURP phospho-peptide 提交 2022-05-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；50 mM Tris pH 7.5, 30 % PEG 6000
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.249 |
| 9C0Y Clathrin terminal domain complexed with Pitstop 2c 提交 2024-05-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–364（364 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 A1ATR N-{(5Z)-4-oxo-5-[(2-phenoxyphenyl)methylidene]-4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl}naphthalene-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 0.1 M TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature
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分辨率 1.40 Å R-free 0.206 |
| 9C0Z Clathrin terminal domain complexed with pitstop 2d 提交 2024-05-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–364（363 aa）
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未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 A1ATQ ~{N}-[4-oxidanylidene-5-[(2-phenoxyphenyl)methylidene]-1,3-thiazol-2-yl]naphthalene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 0.1 M TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.186 |