当前蛋白身份：Q00653
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A3Q HUMAN NF-KAPPA-B P52 BOUND TO DNA 提交 1998-01-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
37–327（291 aa）
链 B
37–327（291 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；THE PROTEIN-DNA COMPLEX WAS CRYSTALLIZED USING THE HANGING DROP METHOD. THE RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 5% PEG 4000, 5 MM MGSO4, 50 MM MES PH 6.0 AND 3 MM DTT. DROPS CONTAINED A 1:1 MIXTURE OF COMPLEX SOLUTION AND RESERVOIR SOLUTION., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.10 Å R-free 0.320 |
| 2D96 Solution structure of the Death domain of Nuclear factor NF-kappa-B p100 提交 2005-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
766–861（96 aa）
片段：death domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.15mM death domain U-15N, 13C, 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3DO7 X-ray structure of a NF-kB p52/RelB/DNA complex 提交 2008-07-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
37–329（293 aa）
片段：RHR (UNP residues 37-329)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；6% PEG 4000, 50 mM NaCl, 0.1% BOG, 10 mM DTT, 10 mM NaCitrate and 2 mM Spermidine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.05 Å R-free 0.273 |
| 4OT9 crystal structure of the C-terminal domain of p100/NF-kB2 提交 2014-02-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
407–765（359 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；10% PEG 4000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.35 Å R-free 0.272 |
| 4OT9 crystal structure of the C-terminal domain of p100/NF-kB2 提交 2014-02-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
407–765（359 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；10% PEG 4000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.272 |
| 5ZMC Structural Basis for Reactivation of -146C>T Mutant TERT Promoter by cooperative binding of p52 and ETS1/2 提交 2018-04-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
35–329（295 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 2.0 M Ammonium sulphate
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分辨率 2.99 Å R-free 0.288 |
| 7CLI Structure of NF-kB p52 homodimer bound to P-Selectin kB DNA fragment 提交 2020-07-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–398（398 aa）
链 B
1–398（398 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M Sodium malonate, pH 4.0, 0.2M CsCl, 5% PEG 3350
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分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 7VUP Structure of NF-kB p52 homodimer bound to +1/-1 swap P-Selectin kB DNA fragment 提交 2021-11-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–398（398 aa）
链 B
1–398（398 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium malonate, pH 4.0, 50mM CsCl, 2.5% PEG 3350
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分辨率 3.40 Å R-free 0.286 |
| 7VUQ Structure of NF-kB p52 homodimer bound to A/T-centric P-Selectin kB DNA fragment 提交 2021-11-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–398（398 aa）
链 B
1–398（398 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium malonate, pH 4.0, 50mM CsCl, 2.5% PEG 3350
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分辨率 3.10 Å R-free 0.249 |
| 7W7L Structure of NF-kB p52 homodimer bound to 13-mer A/T-centric P-Selectin kB DNA fragment 提交 2021-12-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–327（327 aa）
链 B
1–327（327 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50mM MES, pH 6.0, 10mM MgCl2, 10% PEG 3350
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分辨率 3.00 Å R-free 0.258 |