当前蛋白身份：Q01968
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2KIE A PH domain within OCRL bridges clathrin mediated membrane trafficking to phosphoinositide metabolis 提交 2009-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–119（119 aa）
片段：N-terminal residues 1-119
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein , 20 mM potassium phosphate | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2QV2 A role of the Lowe syndrome protein OCRL in early steps of the endocytic pathway 提交 2007-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
564–901（338 aa）
片段：ASH-RhoGAP-like tandem domains
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM Hepes, 8.5% PEG8000, 400 mM NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.288 |
| 3QBT Crystal structure of OCRL1 540-678 in complex with Rab8a:GppNHp 提交 2011-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
540–678（139 aa）
片段：unp residues 540-678
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.16 M ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3QBT Crystal structure of OCRL1 540-678 in complex with Rab8a:GppNHp 提交 2011-01-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
540–678（139 aa）
片段：unp residues 540-678
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.16 M ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3QBT Crystal structure of OCRL1 540-678 in complex with Rab8a:GppNHp 提交 2011-01-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
540–678（139 aa）
片段：unp residues 540-678
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.16 M ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3QBT Crystal structure of OCRL1 540-678 in complex with Rab8a:GppNHp 提交 2011-01-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
540–678（139 aa）
片段：unp residues 540-678
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.16 M ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3QIS Recognition of the F&H motif by the Lowe Syndrome protein OCRL 提交 2011-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
536–901（366 aa）
片段：ASH-RhoGAP (UNP residues 536-901)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 4CMN Crystal structure of OCRL in complex with a phosphate ion 提交 2014-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
215–560（346 aa）
片段：5-PHOSPHATASE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 215-560
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突变：YES | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.2 M ZINC ACETATE, 0.1 M NA-CACODYLATE PH 6.5, 10% ISOPROPANOL
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分辨率 3.13 Å R-free 0.263 |