当前蛋白身份:Q02223
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1OQD Crystal structure of sTALL-1 and BCMA 提交 2003-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白数一致 |
链 K
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 L
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 M
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 N
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 O
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 P
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 Q
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
链 R
8–46(39 aa)
片段:extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;dioxane, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 1XU2 The crystal structure of APRIL bound to BCMA 提交 2004-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
5–51(47 aa)
片段:BCMA ECD
链 S
5–51(47 aa)
片段:BCMA ECD
链 T
5–51(47 aa)
片段:BCMA ECD
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;292 K;well solution: 0.1M MES, 5% Peg 8000, 10% Peg 1000, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.213 |
| 2KN1 Solution NMR Structure of BCMA 提交 2009-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
2–50(49 aa)
片段:residues 2-50
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;离子强度(mmCIF原始值)10;压力 ambient
NMR样品组成
900 uM BCMA, 10 mM sodium phosphate, 0.02 % sodium azide, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4ZFO J22.9-xi: chimeric mouse/human antibody against human BCMA (CD269) 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
1–54(54 aa)
片段:Extracellular (N-terminal) domain, UNP residues 1-54
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;1 microliter of the complex at 8 mg/ml with 2 microliters of 21% PEG 3350, 0.1 M BisTris pH 6.5 and 5 mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.209 |
| 4ZFO J22.9-xi: chimeric mouse/human antibody against human BCMA (CD269) 提交 2015-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 K
1–54(54 aa)
片段:Extracellular (N-terminal) domain, UNP residues 1-54
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;1 microliter of the complex at 8 mg/ml with 2 microliters of 21% PEG 3350, 0.1 M BisTris pH 6.5 and 5 mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.209 |
| 6J7W Crystal Structure of Human BCMA in complex with UniAb(TM) VH 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
6–44(39 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;293 K;0.2M sodium malonate pH 4.0 and 20% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 6J7W Crystal Structure of Human BCMA in complex with UniAb(TM) VH 提交 2019-01-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
6–44(39 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;293 K;0.2M sodium malonate pH 4.0 and 20% PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.271 |
| 8HXQ Nanobody1 in complex with human BCMA ECD 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–54(54 aa)
链 D
1–54(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;293 K;0.2 M Ammonium sulfate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, pH6.1
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.274 |
| 8HXR Nanobody2 in complex with human BCMA ECD 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–54(54 aa)
链 D
1–54(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8 M Sodium acetate trihydrate,
0.1 M Bis-Tris Propane pH7.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 8QY9 J22.9-H, fully humanized Fab Fragment based on chimeric J22.9-xi IgG against BCMA 提交 2023-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
7–41(35 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;14% PEG 3350
100 mM BisTris
7.5 mM Cu(II)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.301 |
| 8QYA J22.9-FNY, fully humanized, CDR optimized Fab Fragment based on chimeric J22.9-xi IgG against BCMA; with VH CDR2 glycosylation 提交 2023-10-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
6–41(36 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;PEG 3350
CuCl2
BisTris
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.299 |
| 8QYB J22.9-ISY, fully humanized and CDR optimized Fab Fragment based on chimeric J22.9-xi IgG against BCMA 提交 2023-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
7–41(35 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;14% PEG 3350
7.5 mM CuCl2
BisTris
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.288 |
| 9MQO Crystal structure of BCMA in complex with CA10v2 Fab 提交 2025-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致 |
链 A
1–54(54 aa)
链 D
1–54(54 aa)
链 G
1–54(54 aa)
链 J
1–54(54 aa)
链 M
1–54(54 aa)
链 P
1–54(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.18 M Sodium Chloride, 0.09 M
Phosphate/citrate pH 4.2, 20 % w/v PEG 8000, 0.1M Sodium Malonate
|
分辨率 3.18 Å R-free 0.272 |