当前蛋白身份:Q02385
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 J
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 K
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 L
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 I
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
链 J
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOK Crystal structure of H-2Db in complex with JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 K
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
链 L
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.2M lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 2ZOL Crystal structure of H-2Db in complex with the W513S variant of JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
|
突变:W4S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.15M lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.307 |
| 2ZOL Crystal structure of H-2Db in complex with the W513S variant of JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
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突变:W4S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.15M lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.307 |
| 2ZOL Crystal structure of H-2Db in complex with the W513S variant of JHMV epitope S510 提交 2008-05-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 E
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
链 F
510–518(9 aa)
片段:UNP residues 510-518
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突变:W4S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:W4S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;294 K;0.1M sodium citrate, 28% PEG 3350, 0.15M lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.307 |