当前蛋白身份:Q03012
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6BX3 Structure of histone H3k4 methyltransferase 提交 2017-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 F
117–353(237 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–124(124 aa)
片段:UNP residues 1-124
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350,
0.1 M HEPES ph 7.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.288 |
| 6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–124(124 aa)
片段:UNP residues 1-124
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350,
0.1 M HEPES ph 7.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.288 |
| 6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–124(124 aa)
片段:UNP residues 1-124
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350,
0.1 M HEPES ph 7.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.288 |
| 6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
1–124(124 aa)
片段:UNP residues 1-124
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350,
0.1 M HEPES ph 7.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.288 |
| 6VEN Yeast COMPASS in complex with a ubiquitinated nucleosome 提交 2020-01-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致 |
链 R
2–353(352 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 5
3.5 sec blot time
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分辨率 3.37 Å |