当前蛋白身份:Q03012 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6BX3 Structure of histone H3k4 methyltransferase 提交 2017-12-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 F 117–353(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–124(124 aa) 片段:UNP residues 1-124
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–124(124 aa) 片段:UNP residues 1-124
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–124(124 aa) 片段:UNP residues 1-124
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–124(124 aa) 片段:UNP residues 1-124
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6VEN Yeast COMPASS in complex with a ubiquitinated nucleosome 提交 2020-01-02 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 R 2–353(352 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 5 3.5 sec blot time
分辨率 3.37 Å