当前蛋白身份：Q03111
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5J9S ENL YEATS in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2016-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
片段：UNP residues 1-148
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M K/Na Tartrate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, 2M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.210 |
| 6HPW Crystal structure of ENL (MLLT1) in complex with compound 20 提交 2018-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GKT 3-iodanyl-4-methyl-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-3~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M bis-tris, pH 5.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.281 |
| 6HPX Crystal structure of ENL (MLLT1) in complex with compound 19 提交 2018-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GKQ ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-1-(2-pyrrolidin-1-ylethyl)benzimidazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% medium molecular weight PEG smears, 0.1M citrate, pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.261 |
| 6HPY Crystal structure of ENL (MLLT1) in complex with compound 12 提交 2018-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 GKN 3-[4-[(4-~{tert}-butylphenyl)carbonylamino]phenyl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-tris, pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.260 |
| 6HPZ Crystal structure of ENL (MLLT1) in complex with acetyllysine 提交 2018-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
片段：YEATS domain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ALY N(6)-ACETYLLYSINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；25% PEG 1500
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.296 |
| 6HQ0 Crystal structure of ENL (MLLT1), apo form 提交 2018-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；30% PEG 2000MME, 0.1M KBr
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.237 |
| 6HT0 Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with compound 94 提交 2018-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GQ8 1-cyclopropyl-~{N}-[2-[[(2~{S})-2-methylpyrrolidin-1-yl]methyl]-3~{H}-benzimidazol-5-yl]indazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH 5.5 or 25% PEG Smear Medi-um, 0.1M citrate pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 6HT1 Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with SGC-iMLLT (compound 92) 提交 2018-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GQ5 1-methyl-~{N}-[2-[[(2~{S})-2-methylpyrrolidin-1-yl]methyl]-3~{H}-benzimidazol-5-yl]indazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH 5.5 or 25% PEG Smear Medi-um, 0.1M citrate pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |
| 6T1I Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with piperazine-urea derivative 1 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | M7W 4-(4-ethanoylphenyl)-~{N}-[(6-methoxypyridin-3-yl)methyl]piperazine-1-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 6T1J Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with piperazine-urea derivative 2 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 M7T ~{N}-[[4-(pyrrolidin-1-ylmethyl)phenyl]methyl]-4-thiophen-2-ylcarbonyl-piperazine-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.275 |
| 6T1L Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with piperazine-urea derivative 3 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 M7N ~{N}-[[4-(diethylaminomethyl)phenyl]methyl]-4-pyrimidin-2-yl-piperazine-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1 M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.265 |
| 6T1M Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with benzimidazole-amide derivative 4 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | M8K 4-cyano-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-1~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M bis-tris pH 5.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.275 |
| 6T1N Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with benzimidazole-amide derivative 5 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | M7Z 4-chloranyl-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-3~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M bis-tris pH 5.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.266 |
| 6T1O Crystal structure of MLLT1 (ENL) YEATS domain in complexed with benzimidazole-amide derivative 6 提交 2019-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | M82 4-iodanyl-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-3~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 7B0T Crystal structure of MLLT1 YEATS domain T3 mutant in complex with benzimidazole-amide based compound 1 提交 2020-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomer（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | GKT 3-iodanyl-4-methyl-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-3~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；28% PEG 3350, 0.2M NaOAc, 0.1M Bis-Tris, pH6.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.276 |
| 7B10 Crystal structure of MLLT1 YEATS domain T1 mutant in complex with benzimidazole-amide based compound 1 提交 2020-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomer（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | GKT 3-iodanyl-4-methyl-~{N}-[2-(piperidin-1-ylmethyl)-3~{H}-benzimidazol-5-yl]benzamide × 1 IOD IODIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25% w/v PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.209 |
| 7E74 Crystal structure of ENL YEATS domain T3 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2021-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 7E74 Crystal structure of ENL YEATS domain T3 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2021-02-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 7E74 Crystal structure of ENL YEATS domain T3 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2021-02-25 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 7E74 Crystal structure of ENL YEATS domain T3 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2021-02-25 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 7E7A Crystal structure of apo ENL YEATS domain T3 mutant 提交 2021-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.230 |
| 7E7A Crystal structure of apo ENL YEATS domain T3 mutant 提交 2021-02-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.230 |
| 7E7A Crystal structure of apo ENL YEATS domain T3 mutant 提交 2021-02-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.230 |
| 7E7A Crystal structure of apo ENL YEATS domain T3 mutant 提交 2021-02-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–148（148 aa）
|
突变：N111K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；2M sodium formate, 0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.230 |
| 7E7C Crystal structure of ENL YEATS domain T1 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2021-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG 4000, 0.1M MES pH 6.5, 0.2M Potassium iodide
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.251 |
| 7X88 Crystal structure of ENL YEATS domain T2 mutant in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
突变：Deletion 112-113, V114L | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；291 K；20% (w/v) PE G3350, 0.1M sodium citrate/citric acid pH 4.0, 0.2M sodium citrate tribasic
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.240 |
| 7X8B Crystal structure of ENL T1 mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1M sodium citrate pH5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 7X8B Crystal structure of ENL T1 mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1M sodium citrate pH5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 7X8F Crystal structure of ENL T4 mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
突变：insertions | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.252 |
| 7X8F Crystal structure of ENL T4 mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
|
突变：insertions | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.252 |
| 7X8G Crystal structure of ENL T1(H116P) mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
突变：insertions | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1M sodium citrate pH 5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.230 |
| 7X8G Crystal structure of ENL T1(H116P) mutant YEATS domain in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2022-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
|
突变：insertions | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20 % (w/v) PEG 4000, 0.1M sodium citrate pH 5.6, 20 % (v/v) 2-propanol
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.230 |
| 8PJI MLLT1 in complex with compound 10a 提交 2023-06-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZJF ~{N}-cyclopentyl-1-(3-hydroxyphenyl)imidazole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris pH=7.0
150 mM AmSO4
Gradient 20-30% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.277 |
| 9DUR Cryo-EM Structure of CRBN:dHTC1:ENL YEATS 提交 2024-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
片段：YEATS domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1IQT 2-[3-[2-[4-[[(5~{S})-1,3-bis(oxidanylidene)-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-7-yl]sulfonylamino]piperidin-1-yl]ethylcarbamoyl]phenyl]-~{N}-cyclobutyl-imidazo[1,2-a]pyridine-6-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES/NaOH pH7.4, 150 mM NaCl. DMSO concentrations were kept below 2% (v/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were vitrified using a Leica EM GP plunge freezer operated at 90% humidity and 10 C. Grids were first pre-incubated with 4 uL of 10 uM CRBN-agnostic IKZF1_140-196_Q146A,G151N for 1 minute and then blotted from behind for 4 s. Immediately, 4 uL of mixturewas applied to the grids before blotting for 4 s and plunging into liquid ethane at -181 C
|
分辨率 2.90 Å |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–146（145 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
2–146（145 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 15 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 16 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
2–146（145 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–146（145 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–146（145 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2–146（145 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
2–146（145 aa）
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |