当前蛋白身份:Q04067 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4U1E Crystal structure of the eIF3b-CTD/eIF3i/eIF3g-NTD translation initiation complex 提交 2014-07-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:Trimeric(3) 与蛋白数一致
链 G 1–135(135 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;292 K;PEG 20000, PEG MME 550, imidazole, MES
分辨率 2.00 Å R-free 0.216
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:47-meric(47) 与全部聚合物一致
链 r 48–96(49 aa)
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物一致
链 r 1–274(274 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:44-meric(44) 与全部聚合物一致
链 r 1–135(135 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å