当前蛋白身份:Q06631 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6LQP Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State A) 提交 2020-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:73-meric(73) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6LQQ Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State B) 提交 2020-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 67 PDB 声明:70-meric(70) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6LQR Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State C) 提交 2020-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 65 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.60 Å
6LQU Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State A1) 提交 2020-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6LQV Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State C1) 提交 2020-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6ZQB Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state B2 提交 2020-07-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 68 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 JK 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6ZQC Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state Pre-A1 提交 2020-07-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 68 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 JK 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7AJT Cryo-EM structure of the 90S-exosome super-complex (state Pre-A1-exosome) 提交 2020-09-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 JK 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7D63 Cryo-EM structure of 90S preribosome with inactive Utp24 (state C) 提交 2020-09-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 68 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 RY 1–534(534 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.30 Å
7SUK Structure of Bfr2-Lcp5 Complex Observed in the Small Subunit Processome Isolated from R2TP-depleted Yeast Cells 提交 2021-11-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 67 PDB 声明:70-meric(70) 与全部聚合物一致
链 5 1–534(534 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9G33 Stalled 90S - Utp23-Krr1-deltaC3 提交 2024-07-11 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 62 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 JK 1–534(534 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9N6V SSU processome maturation and disassembly, State A 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 25 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9N6W SSU processome maturation and disassembly, State A* 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 25 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9N6X SSU processome maturation and disassembly, State B 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 34 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
9N6Y SSU processome maturation and disassembly, State C 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:73-meric(73) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 34 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9N6Z SSU processome maturation and disassembly, State D 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.74 Å
9N70 SSU processome maturation and disassembly, State E 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 69 PDB 声明:72-meric(72) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.17 Å
9N72 SSU processome maturation and disassembly, State F 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:73-meric(73) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.94 Å
9N73 SSU processome maturation and disassembly, State G 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 71 PDB 声明:74-meric(74) 与全部聚合物一致
链 NN 1–534(534 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.96 Å