当前蛋白身份:Q07009 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1DF0 Crystal structure of M-Calpain 提交 1999-11-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–700(700 aa) 片段:LARGE (CATALYTIC) SUBUNIT
突变:C105S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;298 K;PEG 6000, MES, SODIUM CHLORIDE, DITHIOTHREITOL, EDTA, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.293
1MDW Crystal Structure of Calcium-Bound Protease Core of Calpain II Reveals the Basis for Intrinsic Inactivation 提交 2002-08-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 19–346(328 aa) 片段:Protease Core Domains I and II (Residues 17-346)
突变:C105S CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;10% PEG6000, 0.1M Sodium Acetate, 30mM calcium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.243
1MDW Crystal Structure of Calcium-Bound Protease Core of Calpain II Reveals the Basis for Intrinsic Inactivation 提交 2002-08-07 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 19–346(328 aa) 片段:Protease Core Domains I and II (Residues 17-346)
突变:C105S CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;10% PEG6000, 0.1M Sodium Acetate, 30mM calcium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.243
1QXP Crystal Structure of a mu-like calpain 提交 2003-09-08 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–49(49 aa)
链 A 636–700(65 aa)
突变:C105S 突变:C105S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;295 K;PEG 6000,morpholino ethane sulfonic acid, sodium chloride, n-nonyl-beta-D-maltoside , pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.311
1QXP Crystal Structure of a mu-like calpain 提交 2003-09-08 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–49(49 aa)
链 B 636–700(65 aa)
突变:C105S 突变:C105S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;295 K;PEG 6000,morpholino ethane sulfonic acid, sodium chloride, n-nonyl-beta-D-maltoside , pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.311
1U5I Crystal Structure analysis of rat m-calpain mutant Lys10 Thr 提交 2004-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–700(700 aa)
突变:K10T, C105S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;298 K;PEG 6000, MES, sodium chloride, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.86 Å R-free 0.283
3BOW Structure of M-calpain in complex with Calpastatin 提交 2007-12-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–700(700 aa)
突变:C105S CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;298 K;pH 6.5, microbatch under paraffin oil, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
3DF0 Calcium-dependent complex between m-calpain and calpastatin 提交 2008-06-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–700(700 aa)
突变:C105S CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;4-9% PEG 3350, 5-10 mM CaCl2, 50-100 mM NaOAc (pH 5.5) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.95 Å R-free 0.299