当前蛋白身份：Q07457
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4R7E Structure of Bre1 RING domain 提交 2014-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
632–700（69 aa）
片段：RING domain (UNP residues 632-700)
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；2.0 M ammonium sulfate and 0.1 mM sodium acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.25 Å R-free 0.247 |
| 7UV8 Rad6-Bre1 Complex 提交 2022-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
1–212（212 aa）
链 V
1–212（212 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；286.15 K；0.05 to 0.1 M MMT buffer and 15-25% PEG400
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 7UVC Rad6(P43L)-Bre1 Complex 提交 2022-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
1–212（212 aa）
链 V
1–212（212 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；286 K；0.05 to 0.1 M MMT buffer and 15-25% PEG400
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.279 |
| 8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 A
637–700（64 aa）
链 B
637–700（64 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.44 Å |
| 8T3T Structure of Bre1-nucleosome complex - state3 提交 2023-06-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
591–700（110 aa）
链 L
591–700（110 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.21 Å |
| 8T3W Structure of Bre1-nucleosome complex - state2 提交 2023-06-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
591–700（110 aa）
链 L
591–700（110 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.25 Å |
| 8T3Y Structure of Bre1-nucleosome complex - state1 提交 2023-06-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
591–700（110 aa）
链 L
591–700（110 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.47 Å |
| 9M3I Crystal structure of the Bre1-Lge1 complex 提交 2025-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
313–700（388 aa）
链 B
313–700（388 aa）
链 D
227–312（86 aa）
链 E
227–312（86 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；120 mM ammonium citrate (pH 7.0), 12 % polyethylene glycol monomethyl ether (molecular weight 5000 Da), 0.5% beta-mercaptoethanol and 20 mM dithiothreitol
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分辨率 3.50 Å R-free 0.325 |