当前蛋白身份:Q08AJ9
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6USJ Structure of two nucleosomes bridged by human PARP2 提交 2019-10-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130(130 aa)
链 G
1–130(130 aa)
链 M
1–130(130 aa)
链 Q
1–130(130 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Buffer was pH-adjusted and filtered through a 0.22 um filter.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot time 2s, blot force 0
|
分辨率 10.50 Å |
| 6V2K The nucleosome structure after H2A-H2B exchange 提交 2019-11-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130(130 aa)
链 G
1–130(130 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.248 |
| 7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130(130 aa)
链 G
1–130(130 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–130(130 aa)
链 G
1–130(130 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |
| 7XCR Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 1:1 complex 提交 2022-03-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 C
12–119(108 aa)
链 G
12–119(108 aa)
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 7XCT Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 2:1 complex 提交 2022-03-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致 |
链 C
12–119(108 aa)
链 G
12–119(108 aa)
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.72 Å |
| 7XD0 cryo-EM structure of H2BK34ub nucleosome 提交 2022-03-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 C
12–119(108 aa)
链 G
12–119(108 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.48 Å |