当前蛋白身份：Q12315
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3PEU S. cerevisiae Dbp5 L327V C-terminal domain bound to Gle1 H337R and IP6 提交 2010-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；30% PEG 3350, 100 mM HEPES pH 8.0, 50 mM NaOAc, 200mM LiS04, 10 mM HEPES pH 7.5, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.5 mM IP6, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.213 |
| 3PEU S. cerevisiae Dbp5 L327V C-terminal domain bound to Gle1 H337R and IP6 提交 2010-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；30% PEG 3350, 100 mM HEPES pH 8.0, 50 mM NaOAc, 200mM LiS04, 10 mM HEPES pH 7.5, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.5 mM IP6, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.213 |
| 3PEV S. cerevisiae Dbp5 L327V C-terminal domain bound to Gle1 and IP6 提交 2010-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；30% PEG 3350, 100 mM HEPES pH 7.8, 200mM LiS04, 10mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM DTT, 0.5 mM IP6, 5% glycerol
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 3PEV S. cerevisiae Dbp5 L327V C-terminal domain bound to Gle1 and IP6 提交 2010-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；30% PEG 3350, 100 mM HEPES pH 7.8, 200mM LiS04, 10mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM DTT, 0.5 mM IP6, 5% glycerol
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 3RRM S. cerevisiae dbp5 l327v bound to nup159, gle1 h337r, ip6 and adp 提交 2011-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
片段：unp residues 244-538
|
突变：H337R | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 200 mM KOAc, 20 mM sarcosine, 10 mM HEPES, 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.5 mM IP6, 10 mM MgCl2, 1 mM ADP, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.261 |
| 3RRN S. cerevisiae dbp5 l327v bound to gle1 h337r and ip6 提交 2011-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
244–538（295 aa）
片段：unp residues 244-538
|
突变：H337R | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；30% PEG 300, 100mM MES, 2% MPD, 10 mM HEPES, 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.5 mM IP6, 0.5 mM ADP, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.5
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分辨率 4.00 Å R-free 0.239 |
| 6B4E Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Gle1 CTD-Nup42 GBM complex 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
243–538（296 aa）
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未记录 | PRO PROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M HEPES pH 8.2, 11 % (w/v/) PEG 3350, 0.2 M L-Proline
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分辨率 1.75 Å R-free 0.211 |
| 6B4E Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Gle1 CTD-Nup42 GBM complex 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
243–538（296 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PRO PROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M HEPES pH 8.2, 11 % (w/v/) PEG 3350, 0.2 M L-Proline
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.211 |