当前蛋白身份：Q12386
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4AM6 C-TERMINAL DOMAIN OF ACTIN-RELATED PROTEIN ARP8 FROM S. CEREVISIAE 提交 2012-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
248–881（634 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 248-881
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；18% W/V PEG 5000 MME, 0.28 M LI2SO4, 0.1 M NA-CACODYLATE PH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.286 |
| 4AM6 C-TERMINAL DOMAIN OF ACTIN-RELATED PROTEIN ARP8 FROM S. CEREVISIAE 提交 2012-03-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
248–881（634 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 248-881
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；18% W/V PEG 5000 MME, 0.28 M LI2SO4, 0.1 M NA-CACODYLATE PH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.286 |
| 4AM7 ADP-BOUND C-TERMINAL DOMAIN OF ACTIN-RELATED PROTEIN ARP8 FROM S. CEREVISIAE 提交 2012-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
248–881（634 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 248-881
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；19.5% W/V PEG 5000 MME, 0.32 M LI2SO4, 0.1 M MES PH 6.5, 0.002 M ADP, 0.005 M MGCL2
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.284 |
| 4AM7 ADP-BOUND C-TERMINAL DOMAIN OF ACTIN-RELATED PROTEIN ARP8 FROM S. CEREVISIAE 提交 2012-03-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
248–881（634 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 248-881
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；19.5% W/V PEG 5000 MME, 0.32 M LI2SO4, 0.1 M MES PH 6.5, 0.002 M ADP, 0.005 M MGCL2
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.284 |
| 5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
255–881（627 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)
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分辨率 4.00 Å R-free 0.242 |
| 5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
255–881（627 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)
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分辨率 4.00 Å R-free 0.242 |
| 8A5A Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of INO80 提交 2022-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
1–881（881 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 8A5O Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of S. cerevisiae INO80 提交 2022-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
1–881（881 aa）
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未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |