当前蛋白身份:Q12476
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LLI Low resolution structure of RNA-binding subunit of the TRAMP complex 提交 2011-11-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
57–180(124 aa)
片段:UNP residues 57-180
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 8;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0.5;压力 ambient
NMR样品组成
100 uM uM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3NYB Structure and function of the polymerase core of TRAMP, a RNA surveillance complex 提交 2010-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
118–198(81 aa)
片段:fourth and fifth zinc knuckles of Air2p (UNP residues 118-198)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;277 K;100 mM sodium citrate at pH 5.8, 200 mM sodium acetate, 11% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 4U4C The molecular architecture of the TRAMP complex reveals the organization and interplay of its two catalytic activities 提交 2014-07-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:Dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–62(62 aa)
片段:UNP residues 1-62,UNP residues 111-160,UNP residues 1-62,UNP residues 111-160
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;285.15 K;0.1 M Tris pH 8.2,
0.15 M Li2SO4,
32% PEG 400
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分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |