当前蛋白身份:Q12476 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2LLI Low resolution structure of RNA-binding subunit of the TRAMP complex 提交 2011-11-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 57–180(124 aa) 片段:UNP residues 57-180
未记录 ZN ZINC ION × 5 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0.5;压力 ambient
NMR样品组成 100 uM uM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3NYB Structure and function of the polymerase core of TRAMP, a RNA surveillance complex 提交 2010-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 118–198(81 aa) 片段:fourth and fifth zinc knuckles of Air2p (UNP residues 118-198)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;277 K;100 mM sodium citrate at pH 5.8, 200 mM sodium acetate, 11% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
4U4C The molecular architecture of the TRAMP complex reveals the organization and interplay of its two catalytic activities 提交 2014-07-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:Dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–62(62 aa) 片段:UNP residues 1-62,UNP residues 111-160,UNP residues 1-62,UNP residues 111-160
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;285.15 K;0.1 M Tris pH 8.2, 0.15 M Li2SO4, 32% PEG 400
分辨率 2.40 Å R-free 0.240