当前蛋白身份：Q12802
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LG1 Solution structure of the human AKAP13 PH domain and stabilizing DH helix 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2164–2346（183 aa）
片段：PH domain residues 2164-2346
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）150.00；压力 1.00
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] AKAP13a_A10, 50.0 mM sodium phosphate, 150.0 mM sodium chloride, 0.1 mM Sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4D0N AKAP13 (AKAP-Lbc) RhoGEF domain in complex with RhoA 提交 2014-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1968–2338（371 aa）
片段：RHOGEF DOMAIN, RESIDUES 1968-2338
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未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 25% (W/V) PEG 3350
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分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 4D0O AKAP13 (AKAP-Lbc) DH domain 提交 2014-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1972–2207（236 aa）
片段：RHOGEF DOMAIN, RESIDUES 1972-2207
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 25% (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.308 |
| 4D0O AKAP13 (AKAP-Lbc) DH domain 提交 2014-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1972–2207（236 aa）
片段：RHOGEF DOMAIN, RESIDUES 1972-2207
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 25% (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.308 |
| 6BCA A Complex between PH Domain of LbcRhoGEF (AKAP-Lbc) and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2173–2313（141 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；24-26% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, 200mM ammonium sulfate
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分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 6BCA A Complex between PH Domain of LbcRhoGEF (AKAP-Lbc) and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2173–2313（141 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；24-26% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, 200mM ammonium sulfate
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分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |