当前蛋白身份：Q13009
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3KZD Crystal Structure of Free T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain 提交 2009-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ Domain
|
突变：Q844H | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；288 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M NaSCN, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.224 |
| 3KZE Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in Complex With SSRKEYYA Peptide 提交 2009-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ Domain
链 B
841–930（90 aa）
片段：PDZ Domain
链 C
841–930（90 aa）
片段：PDZ Domain
|
突变：Q844H 突变：Q844H 突变：Q844H | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；288 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M Na2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 4GVC Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with phosphorylated Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain (UNP residues 841-930)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M sodium acetate, 25% PEG4000, 8% isopropanol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.200 |
| 4GVD Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain (UNP residues 841-930)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M MES, 20% PEG8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 4GVD Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain (UNP residues 841-930)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M MES, 20% PEG8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 4K2O The Structure of a Triple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain 提交 2013-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
429–702（274 aa）
片段：PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702)
|
突变：K596A, K597A, K598A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris, 20% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.220 |
| 4K2P The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain 提交 2013-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
429–702（274 aa）
片段：PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702)
|
突变：K596A, K597A, K598A, M580L, M586L | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, 19% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.236 |
| 4K2P The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain 提交 2013-04-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
429–702（274 aa）
片段：PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702)
|
突变：K596A, K597A, K598A, M580L, M586L | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, 19% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.236 |
| 4K2P The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain 提交 2013-04-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
429–702（274 aa）
片段：PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702)
|
突变：K596A, K597A, K598A, M580L, M586L | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, 19% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.236 |
| 4K2P The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain 提交 2013-04-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
429–702（274 aa）
片段：PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702)
|
突变：K596A, K597A, K598A, M580L, M586L | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, 19% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.236 |
| 4NXP Crystal Structure of Free T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain Quadruple Mutant (QM) 提交 2013-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain
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突变：L911M, K912E, L915F, L920V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；1.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Tris, pH=8.5, 12% Glycerol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4NXQ Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain Quadruple Mutant (QM) in Complex With Caspr4 Peptide 提交 2013-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain
|
突变：L911M, K912E, L915F, L920V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1M Magnesium chloride, 0.1M MES, pH=6.5, 20% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 4NXQ Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain Quadruple Mutant (QM) in Complex With Caspr4 Peptide 提交 2013-12-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain
|
突变：L911M, K912E, L915F, L920V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1M Magnesium chloride, 0.1M MES, pH=6.5, 20% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 4NXQ Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain Quadruple Mutant (QM) in Complex With Caspr4 Peptide 提交 2013-12-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain
|
突变：L911M, K912E, L915F, L920V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1M Magnesium chloride, 0.1M MES, pH=6.5, 20% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 4NXR Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ Domain Quadruple Mutant (QM) in Complex With Neurexin-1 Peptide 提交 2013-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
841–930（90 aa）
片段：PDZ domain
|
突变：L911M, K912E, L915F, L920V | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1M Sodium acetate, 0.1M HEPES, pH=7.5, 22% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |