当前蛋白身份:Q13258 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8ZVZ Cryo-EM strcuture of Prostaglandin D2 Receptor DP1 activated by BW245C 提交 2024-06-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–340(340 aa)
未记录 A1AF8 7-{(4S)-3-[(3R)-3-cyclohexyl-3-hydroxypropyl]-2,5-dioxoimidazolidin-4-yl}heptanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å
8ZW0 Cryo-EM strcuture of Prostaglandin D2 Receptor DP1 activated by PGD2 提交 2024-06-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–340(340 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 PG2 PROSTAGLANDIN D2 × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
9AU0 Cryo-EM structure of the BW245C-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-Gs complex 提交 2024-02-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–359(359 aa)
未记录 A1AF8 7-{(4S)-3-[(3R)-3-cyclohexyl-3-hydroxypropyl]-2,5-dioxoimidazolidin-4-yl}heptanoic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
9E9S Cryo-EM structure of the PGD2-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-Gs complex 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–359(359 aa)
未记录 PG2 PROSTAGLANDIN D2 × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
9EE5 Cryo-EM structure of the ONO2550289-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-11-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–233(233 aa)
链 A 258–359(102 aa)
未记录 A1BIL [2-chloro-5-(2,6-dimethyl-4-{[(2S)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl]methoxy}benzamido)phenyl]acetic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9EI5 Cryo-EM structure of Apo form of prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-11-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–233(233 aa)
链 A 258–359(102 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
9EKH Cryo-EM structure ONO3030297-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-12-02 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–233(233 aa)
链 A 258–359(102 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1BI8 1-[2-chloro-5-(2,6-dimethyl-4-{[(2S)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl]methoxy}benzamido)phenyl]cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9UWD Cryo-EM structure of inactive-DP1 提交 2025-05-12 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–232(232 aa)
链 A 258–340(83 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å