当前蛋白身份：Q13283
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3Q90 Crystal structure of the NTF2 domain of Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 提交 2011-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
片段：unp residues 1-139
链 B
1–139（139 aa）
片段：unp residues 1-139
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% w/v PEG3350, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1M BIS-TRIS, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 5.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.238 |
| 4FCJ Crystal structure of the NTF2-like domain of human G3BP1 提交 2012-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
片段：NTF2-like domain
链 B
1–139（139 aa）
片段：NTF2-like domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；20% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.231 |
| 4FCM Crystal structure of the NTF2-like domain of human G3BP1 in complex with a peptide 提交 2012-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
片段：NTF2-like domain
链 B
1–139（139 aa）
片段：NTF2-like domain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；279 K；20% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.282 |
| 4IIA Low resolution crystal structure of the NTF2-like domain of human G3BP1 提交 2012-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–139（129 aa）
片段：NTF2-LIKE DOMAIN
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6 M diammonium phosphate, 0.1 M MOPS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.359 |
| 5FW5 Crystal structure of human G3BP1 in complex with Semliki Forest Virus nsP3-25 comprising two FGDF motives 提交 2016-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
片段：NTF2-LIKE, RESIDUES 1-139
链 B
1–139（139 aa）
片段：NTF2-LIKE, RESIDUES 1-139
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 K POTASSIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE PH 4.6, 2 M AMMONIUMSULFATE
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.202 |
| 6TA7 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN G3BP1-NTF2 IN COMPLEX WITH HUMAN CAPRIN1-DERIVED SOLOMON MOTIF 提交 2019-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 E
1–139（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Tris 8.0, 20% w/v PEG 4000 of the Proplex crystallization screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.252 |
| 6TA7 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN G3BP1-NTF2 IN COMPLEX WITH HUMAN CAPRIN1-DERIVED SOLOMON MOTIF 提交 2019-10-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–139（139 aa）
链 F
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Tris 8.0, 20% w/v PEG 4000 of the Proplex crystallization screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.252 |
| 6TA7 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN G3BP1-NTF2 IN COMPLEX WITH HUMAN CAPRIN1-DERIVED SOLOMON MOTIF 提交 2019-10-29 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–139（139 aa）
链 D
1–139（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Tris 8.0, 20% w/v PEG 4000 of the Proplex crystallization screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.252 |
| 7S17 Crystal structure of human G3BP1-NTF2 with three mutations- F15W, F33W, and F124W 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–138（138 aa）
链 B
1–138（138 aa）
|
突变：F15W, F33W, F124W 突变：F15W, F33W, F124W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 8000, 100 mM HEPES
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.271 |
| 7SUO Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein 提交 2021-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–139（138 aa）
链 B
2–139（138 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；20% propan-2-ol, 0.1 M MES monohydrate (pH 6.0), 20% PEG MME 20,000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 7XHF Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with the USP10 derived peptide 提交 2022-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 B
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0; 19 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.254 |
| 7XHG Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with the Caprin-1 derived peptide 提交 2022-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 D
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30 % w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.275 |
| 7XHG Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with the Caprin-1 derived peptide 提交 2022-04-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–139（139 aa）
链 C
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30 % w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.275 |
| 8TH1 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein D3L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 B
1–139（139 aa）
链 C
1–139（139 aa）
链 D
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M sodium thiocyanate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 8TH5 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein P13L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 F
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.336 |
| 8TH5 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein P13L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–139（139 aa）
链 E
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.336 |
| 8TH5 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein P13L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–139（139 aa）
链 H
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.336 |
| 8TH5 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein P13L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–139（139 aa）
链 G
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.336 |
| 8TH5 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the IDR1 of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein P13L mutant 提交 2023-07-13 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–139（139 aa）
链 J
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.336 |
| 8TH6 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to USP10 peptide 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 D
1–139（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.295 |
| 8TH6 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to USP10 peptide 提交 2023-07-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–139（139 aa）
链 C
1–139（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.295 |
| 8TH7 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the Caprin1 peptide 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 B
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；1.8M tri-ammonium citrate pH 7.0
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.277 |
| 8V1L Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with small molecule 提交 2023-11-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
链 C
1–139（139 aa）
|
未记录 | Y9M N-[(2S)-2-fluoro-4,4-dimethylpentanoyl]-3-hydroxy-L-valyl-(betaS)-beta-methyl-L-phenylalanyl-D-alanyl-N-benzyl-N,O-dimethyl-L-homoserinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% PEG 550 MME
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.395 |
| 8V1L Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with small molecule 提交 2023-11-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–139（139 aa）
链 D
1–139（139 aa）
|
未记录 | Y9M N-[(2S)-2-fluoro-4,4-dimethylpentanoyl]-3-hydroxy-L-valyl-(betaS)-beta-methyl-L-phenylalanyl-D-alanyl-N-benzyl-N,O-dimethyl-L-homoserinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% PEG 550 MME
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.395 |
| 8V1L Crystal structure of the NTF2L domain of human G3BP1 in complex with small molecule 提交 2023-11-20 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–139（139 aa）
链 F
1–139（139 aa）
|
未记录 | Y9M N-[(2S)-2-fluoro-4,4-dimethylpentanoyl]-3-hydroxy-L-valyl-(betaS)-beta-methyl-L-phenylalanyl-D-alanyl-N-benzyl-N,O-dimethyl-L-homoserinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% PEG 550 MME
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.395 |
| 9CC6 De novo design of high-affinity protein binders to RNA binding domain of G3bp1 提交 2024-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
453–465（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, and 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 9IVQ Cryo-EM structure of the CHIKV nsP3 peptide in complex with the NTF2L domain of G3BP1 (Conformation I) 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–138（138 aa）
链 B
1–138（138 aa）
链 C
1–138（138 aa）
链 D
1–138（138 aa）
链 E
1–138（138 aa）
链 F
1–138（138 aa）
链 G
1–138（138 aa）
链 H
1–138（138 aa）
链 M
1–138（138 aa）
链 N
1–138（138 aa）
链 O
1–138（138 aa）
链 P
1–138（138 aa）
链 Q
1–138（138 aa）
链 R
1–138（138 aa）
链 S
1–138（138 aa）
链 T
1–138（138 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 9IVR Cryo-EM structure of the CHIKV nsP3 peptide in complex with the NTF2L domain of G3BP1 (Conformation II) 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–138（138 aa）
链 B
1–138（138 aa）
链 C
1–138（138 aa）
链 D
1–138（138 aa）
链 E
1–138（138 aa）
链 F
1–138（138 aa）
链 G
1–138（138 aa）
链 H
1–138（138 aa）
链 M
1–138（138 aa）
链 N
1–138（138 aa）
链 O
1–138（138 aa）
链 P
1–138（138 aa）
链 Q
1–138（138 aa）
链 R
1–138（138 aa）
链 S
1–138（138 aa）
链 T
1–138（138 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9IVS Cryo-EM structure of the CHIKV nsP3 peptide in complex with the NTF2L domain of G3BP1 (Conformation III) 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
1–138（138 aa）
链 B
1–138（138 aa）
链 C
1–138（138 aa）
链 D
1–138（138 aa）
链 E
1–138（138 aa）
链 F
1–138（138 aa）
链 G
1–138（138 aa）
链 H
1–138（138 aa）
链 M
1–138（138 aa）
链 N
1–138（138 aa）
链 O
1–138（138 aa）
链 P
1–138（138 aa）
链 Q
1–138（138 aa）
链 R
1–138（138 aa）
链 S
1–138（138 aa）
链 T
1–138（138 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9J5S Crystal structure of human G3BP1 in complex with CHIKV nsP3 peptide 提交 2024-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–138（138 aa）
链 B
1–138（138 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；291 K；20%(w/v) PEG 3350, 200mM Sodium citrate tribasic, 100mM Sodium citrate/Citric acid pH 4.0
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.280 |