当前蛋白身份：Q13404
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2A4D Structure of the human ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 (UEV-1) 提交 2005-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
81–221（141 aa）
片段：catalytic domain, residues 82-220
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；298 K；32% PEG1500, 0.2 M NaCl, 1 mM DTT, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.50
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分辨率 1.69 Å R-free 0.240 |
| 2C2V Crystal structure of the CHIP-UBC13-UEV1a complex 提交 2005-09-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
80–221（142 aa）
链 I
80–221（142 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).
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分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 2C2V Crystal structure of the CHIP-UBC13-UEV1a complex 提交 2005-09-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
80–221（142 aa）
链 L
80–221（142 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；MCHIP(166-304), UBC13 AND UEV1A WERE COMBINED IN A 1:1:1 MOLAR RATIO, INCUBATED FOR 30 MIN, AND CONCENTRATED TO 10 MG/ML BY ULTRAFILTRATION. CRYSTALS WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 20C AGAINST 20% (W/V) PEG2000 MME, 100 MM TRIS-HCL (PH 7.0).
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 2HLW Solution Structure of the Human Ubiquitin-conjugating Enzyme Variant Uev1a 提交 2006-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
74–221（148 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
1mM hUev1a U-15N,13C; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.75mM hUev1a U-15N,U-10% 13C; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM hUev1a U-15N; 50 mM NaH2PO4, 250 mM NaCl, 0.9 mM DTT, 1.7 mM DSS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
8–147（140 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.296 |
| 6D6I Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 提交 2018-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
8–147（140 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
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分辨率 2.55 Å R-free 0.296 |