当前蛋白身份:Q14118
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EG4 STRUCTURE OF A DYSTROPHIN WW DOMAIN FRAGMENT IN COMPLEX WITH A BETA-DYSTROGLYCAN PEPTIDE 提交 2000-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 P
881–895(15 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;ammonium sulfate, glycerol, DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 2MK7 Tetra-O-GalNAc glycosylated mucin sequence from alpha dystroglycan mucin domain 提交 2014-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
419–427(9 aa)
片段:mucin domain peptide (UNP residues 419-427)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5;288 K;压力 ambient
NMR样品组成
2-10 mM aDG mucin domain peptide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
2-10 mM aDG mucin domain peptide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
316–325(10 aa)
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.246 |
| 5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
316–325(10 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.246 |
| 5LLK Crystal structure of human alpha-dystroglycan 提交 2016-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
52–315(264 aa)
片段:UNP residues 52-315
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突变:R168H | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;277 K;0.8 M Sodium Citrate
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分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 6JJY Crystal Structure of KIBRA and beta-Dystroglycan 提交 2019-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 U
877–895(19 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;3.0-4.0M NaCl, 100mM Bis-Tris (pH 6.5)
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分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 8UF4 Crystal structure of wildtype dystroglycan proteolytic domain (juxtamembrane domain) 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
491–653(163 aa)
片段:residues 491-653
链 B
654–748(95 aa)
片段:residues 654-748
链 C
491–653(163 aa)
片段:residues 491-653
链 D
654–748(95 aa)
片段:residues 654-748
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;295 K;0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
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分辨率 2.43 Å R-free 0.275 |