当前蛋白身份:Q14118 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1EG4 STRUCTURE OF A DYSTROPHIN WW DOMAIN FRAGMENT IN COMPLEX WITH A BETA-DYSTROGLYCAN PEPTIDE 提交 2000-02-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 P 881–895(15 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;ammonium sulfate, glycerol, DTT, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.249
2MK7 Tetra-O-GalNAc glycosylated mucin sequence from alpha dystroglycan mucin domain 提交 2014-02-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 419–427(9 aa) 片段:mucin domain peptide (UNP residues 419-427)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5;288 K;压力 ambient
NMR样品组成 2-10 mM aDG mucin domain peptide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 2-10 mM aDG mucin domain peptide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 316–325(10 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
分辨率 1.60 Å R-free 0.246
5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 316–325(10 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
分辨率 1.60 Å R-free 0.246
5LLK Crystal structure of human alpha-dystroglycan 提交 2016-07-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 52–315(264 aa) 片段:UNP residues 52-315
突变:R168H EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;277 K;0.8 M Sodium Citrate
分辨率 1.80 Å R-free 0.195
6JJY Crystal Structure of KIBRA and beta-Dystroglycan 提交 2019-02-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 U 877–895(19 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;3.0-4.0M NaCl, 100mM Bis-Tris (pH 6.5)
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
8UF4 Crystal structure of wildtype dystroglycan proteolytic domain (juxtamembrane domain) 提交 2023-10-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 491–653(163 aa) 片段:residues 491-653
链 B 654–748(95 aa) 片段:residues 654-748
链 C 491–653(163 aa) 片段:residues 491-653
链 D 654–748(95 aa) 片段:residues 654-748
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;295 K;0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 2.43 Å R-free 0.275