当前蛋白身份：Q14289
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LK4 Structural and mechanistic insights into the interaction between PAT Pyk2 and Paxillin LD motif 提交 2011-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
片段：Focal adhesion targeting (FAT) region residues 871-1005
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；305 K；离子强度（mmCIF原始值）7；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MES, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3CC6 Crystal structure of kinase domain of protein tyrosine kinase 2 beta (PTK2B) 提交 2008-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
414–692（279 aa）
片段：Kinase domain: Residues 414-692
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.05M Magnesium chloride, 0.1M Bis-tris, 17.5% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.219 |
| 3ET7 Crystal structure of PYK2 complexed with PF-2318841 提交 2008-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
|
未记录 | 349 5-{[4-{[2-(pyrrolidin-1-ylsulfonyl)benzyl]amino}-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino}-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.328 |
| 3FZO Crystal Structure of PYK2-Apo, Proline-rich Tyrosine Kinase 提交 2009-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：UNP residues 416-692, Protein kinase domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris, 0.2M MgCl2, 20-27% PEG3350, 1mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.265 |
| 3FZP Crystal structure of PYK2 complexed with ATPgS 提交 2009-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：UNP residues 416-692, Protein kinase domain
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Citrate, 0.5-1.5M Lithium Sulfate, 0.2-0.4M Ammonium Sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 3FZR Crystal structure of PYK2 complexed with PF-431396 提交 2009-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：UNP residues 416-692, Protein kinase domain
|
未记录 | 3JZ N-methyl-N-{2-[({2-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl}amino)methyl]phenyl}methanesulfonamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；297 K；0.1M Bis-Tris, 0.2M MgCl2, 20-27% PEG3350, 1mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 3FZS Crystal Structure of PYK2 complexed with BIRB796 提交 2009-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：UNP residues 416-692, Protein kinase domain
|
未记录 | B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1M Bis-Tris, 0.2M MgCls, 20-27% PEG3350, 1mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.224 |
| 3FZT Crystal structure of PYK2 complexed with PF-4618433 提交 2009-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：UNP residues 416-692, Protein kinase domain
|
未记录 | 4JZ 1-[5-tert-butyl-2-(4-methylphenyl)-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-ylidene]-3-{3-[(pyridin-3-yloxy)methyl]-1H-pyrazol-5-yl}urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1M Bis-Tris, 0.2M MgCl2, 20-27% PEG3350, 1mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.242 |
| 3GM1 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 in Complex with Paxillin LD4 Motif-Derived Peptides 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
861–1009（149 aa）
片段：Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain, UNP residues 861-1009
|
突变：C899A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；4.1 M NaCl, 100 mM HEPES, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 3GM1 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 in Complex with Paxillin LD4 Motif-Derived Peptides 提交 2009-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
861–1009（149 aa）
片段：Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain, UNP residues 861-1009
|
突变：C899A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；4.1 M NaCl, 100 mM HEPES, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 3GM2 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
861–1009（149 aa）
片段：Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain, UNP residues 861-1009
|
突变：C899A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；298 K；3.4 M NaCl, 100 mM HEPES, 1% glycerol, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.295 |
| 3GM3 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
861–1009（149 aa）
片段：Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain, UNP residues 861-1009
|
突变：C899A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 8000, 100mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.289 |
| 3H3C Crystal structure of PYK2 in complex with Sulfoximine-substituted trifluoromethylpyrimidine analog 提交 2009-04-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 P1E 4-{[4-{[(1R,2R)-2-(dimethylamino)cyclopentyl]amino}-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino}-N-methylbenzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M MgCl2, 20-27% PEG3350, 1mM TCEP, 0.1M bis-Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.273 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
片段：unp residues 871-1005
|
突变：C899S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
871–1005（135 aa）
片段：unp residues 871-1005
|
突变：C899S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
871–1005（135 aa）
片段：unp residues 871-1005
|
突变：C899S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
871–1005（135 aa）
片段：unp residues 871-1005
|
突变：C899S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 4EKU Crystal Structure of FERM Domain of Proline-rich Tyrosine Kinase 2 提交 2012-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
21–409（389 aa）
片段：UNP residues 21-409
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；1 M AMMONIUM CITRATE TRIBASIC, pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.212 |
| 4EKU Crystal Structure of FERM Domain of Proline-rich Tyrosine Kinase 2 提交 2012-04-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
21–409（389 aa）
片段：UNP residues 21-409
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；1 M AMMONIUM CITRATE TRIBASIC, pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.212 |
| 4H1J Crystal structure of PYK2 with the pyrazole 13a 提交 2012-09-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：protein kinase domain (UNP residues 416-692)
|
未记录 | 0YH 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[3-(4-methoxy-2-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M magnesium chloride, 20-27% PEG3350, 1 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.209 |
| 4H1M Crystal structure of PYK2 with the indole 10c 提交 2012-09-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
片段：protein kinase domain (UNP residues 416-692)
|
未记录 | 0YJ 7-({[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)-N-(propan-2-yl)-1H-indole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；295 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M magnesium chloride, 20-27% PEG3350, 1 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.296 |
| 4R32 Crystal Structure Analysis of Pyk2 and Paxillin LD motifs 提交 2014-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
片段：Focal Adhesion Targeting (FAT) domain (UNP residues 871-1005)
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；THE WELL SOLUTION CONTAINED 100 mM TRIS, 2.0 M AMMONIUM PHOSPHATE MONOBASIC. THE 4 UL DROP CONTAINED 2 uL OF WELL SOLUTION PLUS 2 uL MIXTURE OF PYK2 AND LD2 IN 20 MM MES, PH 6.0, AT 1 mM PROTEIN TO 2 mM PEPTIDE RATIO , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.240 |
| 4XEF Pyk2-FAT complexed with Leupaxin LD motif LD1 提交 2014-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
片段：FAT domain (UNP residues 871-1005)
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；400 nl drop contained 200 nl protein/LD1 peptide mixture (20 mM MES, pH 6.2, 1 mM protein, and 2 mM peptide) and 200 nl well solution (100 mM Tris, pH 8.5, 0.2 M MgCl2, and 30% PEG 4000).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 4XEF Pyk2-FAT complexed with Leupaxin LD motif LD1 提交 2014-12-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
871–1005（135 aa）
片段：FAT domain (UNP residues 871-1005)
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；400 nl drop contained 200 nl protein/LD1 peptide mixture (20 mM MES, pH 6.2, 1 mM protein, and 2 mM peptide) and 200 nl well solution (100 mM Tris, pH 8.5, 0.2 M MgCl2, and 30% PEG 4000).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 4XEK Pyk2-FAT domain in complex with leupaxin LD4 motif 提交 2014-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
片段：FAT domain (UNP residues 871-1005)
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291.2 K；4 ul drop contained 2 ul protein/LD4 peptide mixture (20 mM MES, pH 6.2, 1 mM protein, and 2 mM peptide) and 2 ul well solution (100 mM Tris pH 9.0 and 45 % PEG 600)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.231 |
| 4XEV Fusion of Pyk2-FAT domain with Leupaxin LD1 motif, complexed with Leupaxin LD4 peptide 提交 2014-12-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
871–1005（135 aa）
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein/LD4 peptide mixture (20 mM MES pH 6.2, 1 mM protein, and 2 mM peptide) and 2 ul well solution (100 mM MES pH 6.5 and 25 % PEG 3000).
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.250 |
| 4XEV Fusion of Pyk2-FAT domain with Leupaxin LD1 motif, complexed with Leupaxin LD4 peptide 提交 2014-12-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
871–1005（135 aa）
|
突变：C899S, C972A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein/LD4 peptide mixture (20 mM MES pH 6.2, 1 mM protein, and 2 mM peptide) and 2 ul well solution (100 mM MES pH 6.5 and 25 % PEG 3000).
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.250 |
| 5TO8 Selectivity switch between FAK and Pyk2: Macrocyclization of FAK inhibitors improves Pyk2 potency 提交 2016-10-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
414–692（279 aa）
片段：UNP Residues 414-692
|
未记录 | 7FM 25-(methylsulfonyl)-8-(trifluoromethyl)-5,17,18,21,22,23,24,25-octahydro-12H-7,11-(azeno)-16,13-(metheno)pyrido[3,2-i]pyrrolo[1,2-q][1,3,7,11,17]pentaazacyclohenicosin-20(6H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；19% PEG1000, 100 mM LiSulfate, 50 mM Disodium hydrogen phosphate, 50 mM Citric Acid
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.235 |
| 5TOB Selectivity switch between FAK and Pyk2: Macrocyclization of FAK inhibitors improves Pyk2 potency 提交 2016-10-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
414–692（279 aa）
片段：UNP Residues 414-692
|
未记录 | YAM N-methyl-N-{3-[({2-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl}amino)methyl]pyridin-2-yl}methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25% PEG3350, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 100 mM MgCl2
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.262 |
| 6LF3 3D domain-swapped dimer of the maltose-binding protein fused to a fragment of the protein-tyrosine kinase 2-beta 提交 2019-11-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
790–839（50 aa）
链 B
790–839（50 aa）
|
突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A 突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；298 K；30% (v/v) PEG 400, 0.1M CAPS/Sodium hydroxide
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 6LF3 3D domain-swapped dimer of the maltose-binding protein fused to a fragment of the protein-tyrosine kinase 2-beta 提交 2019-11-28 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
790–839（50 aa）
链 D
790–839（50 aa）
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突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A 突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；298 K；30% (v/v) PEG 400, 0.1M CAPS/Sodium hydroxide
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分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 6LF3 3D domain-swapped dimer of the maltose-binding protein fused to a fragment of the protein-tyrosine kinase 2-beta 提交 2019-11-28 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
790–839（50 aa）
链 F
790–839（50 aa）
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突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A 突变：surface entropy reduction mutant, D83A,K84A,E173A,N174A,K240A,E360A,K363A,D364A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；298 K；30% (v/v) PEG 400, 0.1M CAPS/Sodium hydroxide
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分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 8XOX The Crystal Structure of FAK2 from Biortus. 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
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未记录 | YAM N-methyl-N-{3-[({2-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl}amino)methyl]pyridin-2-yl}methanesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M LiCl2, 0.1M Tris pH8.0, 20% PEG 6000
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分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 8YGX Structure of the PYK2 from Biortus. 提交 2024-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
416–692（277 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH5.5-5.9, 19-29% PEG3,350,1mM TCEP
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分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |