当前蛋白身份:Q14444
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WBE Crystal structure of the HR-1 domain of human caprin-1 in the C121 space group 提交 2014-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
132–251(120 aa)
片段:unp residues 132-251
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;22% PEG750MME, 0.1 M Tris, 0.1 M potassium fluoride, 10% glycerol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 4WBE Crystal structure of the HR-1 domain of human caprin-1 in the C121 space group 提交 2014-09-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
132–251(120 aa)
片段:unp residues 132-251
链 C
132–251(120 aa)
片段:unp residues 132-251
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;22% PEG750MME, 0.1 M Tris, 0.1 M potassium fluoride, 10% glycerol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 4WBP Crystal structure of the HR-1 domain of human caprin-1 in the P3121 space group 提交 2014-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
132–251(120 aa)
片段:unp residues 132-251
链 B
132–251(120 aa)
片段:unp residues 132-251
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;12% PEG600, 0.1 M Tris, 0.1 M Calcium acetate, 10% glycerol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 6TA7 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN G3BP1-NTF2 IN COMPLEX WITH HUMAN CAPRIN1-DERIVED SOLOMON MOTIF 提交 2019-10-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 H
356–386(31 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2M Sodium chloride, 0.1M Tris 8.0, 20% w/v PEG 4000 of the Proplex crystallization screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.252 |
| 6TA7 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN G3BP1-NTF2 IN COMPLEX WITH HUMAN CAPRIN1-DERIVED SOLOMON MOTIF 提交 2019-10-29 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 G
356–386(31 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2M Sodium chloride, 0.1M Tris 8.0, 20% w/v PEG 4000 of the Proplex crystallization screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.252 |
| 8TH7 Crystal Structure of the G3BP1 NTF2-like domain bound to the Caprin1 peptide 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
360–381(22 aa)
链 D
360–381(22 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291.15 K;1.8M tri-ammonium citrate pH 7.0
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.277 |
| 9HFU Caprin1 peptide bound to SPOP MATH domain 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
426–442(17 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 0.03 M sodium fluoride, 0.03 M sodium bromide, 0.03 M sodium iodide, 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 9HFU Caprin1 peptide bound to SPOP MATH domain 提交 2024-11-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
426–442(17 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 0.03 M sodium fluoride, 0.03 M sodium bromide, 0.03 M sodium iodide, 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |