当前蛋白身份：Q15075
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HYI SOLUTION STRUCTURE OF THE EEA1 FYVE DOMAIN COMPLEXED WITH INOSITOL 1,3-BISPHOSPHATE 提交 2001-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1346–1410（65 aa）
片段：FYVE DOMAIN (RESIDUES 1346-1410)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ITP PHOSPHORIC ACID MONO-(2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-PHOSPHONOOXY-CYCLOHEXYL) ESTER × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM KCl；压力 1
NMR样品组成
1mM FYVE domain; 20 mM d-Tris buffer; pH 6.7; 200 mM KCl; 20 mM d-DTT; 1 mM NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM FYVE domain; 20 mM d-Tris buffer; pH 6.7; 200 mM KCl; 20 mM d-DTT; 1 mM NaN3 | 99.99% D2O
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分辨率未提供 |
| 1HYJ SOLUTION STRUCTURE OF THE EEA1 FYVE DOMAIN 提交 2001-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1346–1410（65 aa）
片段：FYVE DOMAIN (RESIDUES 1346-1410)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM KCl；压力 1
NMR样品组成
1mM FYVE domain; 20 mM d-Tris buffer; pH 6.7; 200 mM KCl; 20 mM d-DTT; 1 mM NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM FYVE domain; 20 mM d-Tris buffer; pH 6.7; 200 mM KCl; 20 mM d-DTT; 1 mM NaN3 | 99.99% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1JOC EEA1 homodimer of C-terminal FYVE domain bound to inositol 1,3-diphosphate 提交 2001-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1287–1410（124 aa）
片段：C-terminal domain, FYVE domain
链 B
1287–1410（124 aa）
片段：C-terminal domain, FYVE domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ITP PHOSPHORIC ACID MONO-(2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-PHOSPHONOOXY-CYCLOHEXYL) ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；11% PEG 4000, 50 mM HEPES, 60 mM ammonium acetate, 10% glycerol, and 1.5 mM Ins(1,3)P2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.281 |
| 3MJH Crystal Structure of Human Rab5A in complex with the C2H2 Zinc Finger of EEA1 提交 2010-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
36–69（34 aa）
片段：C2H2-type, residues 36-69
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；18% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 0.2M sodium-potassium phosphate, 10% glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.260 |
| 3MJH Crystal Structure of Human Rab5A in complex with the C2H2 Zinc Finger of EEA1 提交 2010-04-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
36–69（34 aa）
片段：C2H2-type, residues 36-69
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；18% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 0.2M sodium-potassium phosphate, 10% glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.0K
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分辨率 2.03 Å R-free 0.260 |