当前蛋白身份:Q15113 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1UAP NMR structure of the NTR domain from human PCOLCE1 提交 2003-03-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 313–442(130 aa) 片段:NTR domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;301 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7.5;301 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成 1mM NTR(PCOLCE1) U-15N | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM NTR(PCOLCE1) | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM NTR(PCOLCE1) | 100% D2O
分辨率未提供
6FZV Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (short) 提交 2018-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 26–278(253 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M potassium citrate, 16% PEG3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6FZW Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long) 提交 2018-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 26–278(253 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 FLC CITRATE ANION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;20 mg/ml protein in 20 mM HEPES pH 7.5, 180 mM NaCl, 2.5 mM calcium chloride; 0.2 M ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.78 Å R-free 0.271
9EN2 Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 complexed with nanobodies VHH-H4 and VHH-I5 提交 2024-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–277(253 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;292.15 K;10% PEG 8000, 50 mM L-argininamide dihydrochloride, 50 mM spermine, 50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 50 mM potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.242