当前蛋白身份:Q15276 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 435–447(13 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;1.6M sodium citrate, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 435–447(13 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;1.6M sodium citrate, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 789–862(74 aa)
链 G 789–862(74 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.277
1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 H 789–862(74 aa)
链 I 789–862(74 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.277
1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 J 789–862(74 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.277
1X79 Crystal structure of human GGA1 GAT domain complexed with the GAT-binding domain of Rabaptin5 提交 2004-08-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 551–661(111 aa)
链 C 551–661(111 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;AMMONIUM SULFATE, TRIS, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
4N3Y Crystal structure of Rabex-5CC and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
链 C 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.15M MgAc2, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4N3Z Crystal structure of Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
链 C 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;289 K;2.0M NaH2PO4/K2HPO4, 0.05% n-octyl-beta-D-galactopyranoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.10 Å R-free 0.315
4Q9U Crystal structure of the Rab5, Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2014-05-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
链 D 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
链 G 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
链 H 552–642(91 aa) 片段:UNP residues 552-642
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 5;289 K;1.0M NaH2PO4/K2HPO4, pH 5.0, hanging drop, temperature 289K
分辨率 4.62 Å R-free 0.343