当前蛋白身份:Q15276
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
435–447(13 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;1.6M sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
435–447(13 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;1.6M sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 F
789–862(74 aa)
链 G
789–862(74 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.277 |
| 1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 H
789–862(74 aa)
链 I
789–862(74 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.277 |
| 1TU3 Crystal Structure of Rab5 complex with Rabaptin5 C-terminal Domain 提交 2004-06-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 J
789–862(74 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;PEG3350, ammonium bromide, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.277 |
| 1X79 Crystal structure of human GGA1 GAT domain complexed with the GAT-binding domain of Rabaptin5 提交 2004-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
551–661(111 aa)
链 C
551–661(111 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;AMMONIUM SULFATE, TRIS, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.41 Å R-free 0.283 |
| 4N3Y Crystal structure of Rabex-5CC and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
链 C
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.15M MgAc2, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 4N3Z Crystal structure of Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
链 C
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;289 K;2.0M NaH2PO4/K2HPO4, 0.05% n-octyl-beta-D-galactopyranoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.315 |
| 4Q9U Crystal structure of the Rab5, Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2014-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 C
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
链 D
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
链 G
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
链 H
552–642(91 aa)
片段:UNP residues 552-642
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 5;289 K;1.0M NaH2PO4/K2HPO4, pH 5.0, hanging drop, temperature 289K
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分辨率 4.62 Å R-free 0.343 |