当前蛋白身份:Q15435 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–360(360 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.09 Å R-free 0.239
6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–360(360 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.09 Å R-free 0.239
6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–360(360 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.09 Å R-free 0.239
6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 1–360(360 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.09 Å R-free 0.239
6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 1–360(360 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.09 Å R-free 0.239
6MKY Human SDS22 提交 2018-09-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 57–317(261 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.01 M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.1 M HEPES 7.5, 25 % v/v PEG Smear Medium (12.5%w/v PEG 3350 12.5%w/v PEG 4000 12.5%w/v PEG 2000 12.5%w/v PEG 5000 MME)
分辨率 2.90 Å R-free 0.272
6MKY Human SDS22 提交 2018-09-26 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 57–317(261 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.01 M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.1 M HEPES 7.5, 25 % v/v PEG Smear Medium (12.5%w/v PEG 3350 12.5%w/v PEG 4000 12.5%w/v PEG 2000 12.5%w/v PEG 5000 MME)
分辨率 2.90 Å R-free 0.272
6OBN The crystal structure of coexpressed SDS22:PP1 complex 提交 2019-03-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 56–360(305 aa) 片段:UNP residues 56-360
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 FE FE (III) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
6OBN The crystal structure of coexpressed SDS22:PP1 complex 提交 2019-03-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 56–360(305 aa) 片段:UNP residues 56-360
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 FE FE (III) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
6OBP Reconstituted PP1 holoenzyme 提交 2019-03-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 56–360(305 aa) 片段:UNP residues 56-360
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
8B5R p97-p37-SPI substrate complex 提交 2022-09-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 S 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
8U5G Crystal structure of the co-expressed SDS22:PP1:I3 complex 提交 2023-09-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 56–360(305 aa)
未记录 FE FE (III) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.2;289 K;1.8 M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH 8.2
分辨率 3.20 Å R-free 0.240