当前蛋白身份:Q15435
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–360(360 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.239 |
| 6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–360(360 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.239 |
| 6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–360(360 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.239 |
| 6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
1–360(360 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.239 |
| 6HKW Crystal structure of human SDS22 提交 2018-09-09 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
1–360(360 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium sulfate, PEG 4000, glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.239 |
| 6MKY Human SDS22 提交 2018-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
57–317(261 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.01 M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.1 M HEPES 7.5, 25 % v/v PEG Smear Medium (12.5%w/v PEG 3350
12.5%w/v PEG 4000
12.5%w/v PEG 2000
12.5%w/v PEG 5000 MME)
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 6MKY Human SDS22 提交 2018-09-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
57–317(261 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.01 M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.1 M HEPES 7.5, 25 % v/v PEG Smear Medium (12.5%w/v PEG 3350
12.5%w/v PEG 4000
12.5%w/v PEG 2000
12.5%w/v PEG 5000 MME)
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 6OBN The crystal structure of coexpressed SDS22:PP1 complex 提交 2019-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
56–360(305 aa)
片段:UNP residues 56-360
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 FE FE (III) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
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分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 6OBN The crystal structure of coexpressed SDS22:PP1 complex 提交 2019-03-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
56–360(305 aa)
片段:UNP residues 56-360
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 FE FE (III) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 6OBP Reconstituted PP1 holoenzyme 提交 2019-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
56–360(305 aa)
片段:UNP residues 56-360
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;14% PEG4000, 6% MPD, sodium/potassium phosphate
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分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 8B5R p97-p37-SPI substrate complex 提交 2022-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致 |
链 S
1–360(360 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.10 Å |
| 8U5G Crystal structure of the co-expressed SDS22:PP1:I3 complex 提交 2023-09-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
56–360(305 aa)
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未记录 | FE FE (III) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.2;289 K;1.8 M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH 8.2
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分辨率 3.20 Å R-free 0.240 |