当前蛋白身份:Q15797 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1KHU Smad1 crystal structure reveals the details of BMP signaling pathway 提交 2001-12-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 248–465(218 aa) 片段:DWB
链 B 248–465(218 aa) 片段:DWB
链 C 248–465(218 aa) 片段:DWB
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.5;298 K;alcohol, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298.0K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
1KHU Smad1 crystal structure reveals the details of BMP signaling pathway 提交 2001-12-01 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 248–465(218 aa) 片段:DWB
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.5;298 K;alcohol, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298.0K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
2LAW Structure of the second WW domain from human YAP in complex with a human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 222–233(12 aa) 片段:residues 222-233
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LAX Structure of first WW domain of human YAP in complex with a human Smad1 doubly-phosphorilated derived peptide. 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 201–209(9 aa) 片段:residues 201-209
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LAY Structure of the first WW domain of human YAP in complex with a phosphorylated human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 201–209(9 aa) 片段:residues 201-209
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LAZ Structure of the first WW domain of human Smurf1 in complex with a mono-phosphorylated human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 210–217(8 aa) 片段:resdieus 210-217
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LB0 Structure of the first WW domain of human Smurf1 in complex with a di-phosphorylated human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 208–217(10 aa) 片段:residues 208-217
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3-1, 3 mM SMAD3-2, 20 mM sodium phosphate-3, 100 mM sodium chloride-4, 2 mM sodium azide-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3-6, 3 mM SMAD3-7, 20 mM sodium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 2 mM sodium azide-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3-11, 3 mM SMAD3-12, 20 mM sodium phosphate-13, 100 mM sodium chloride-14, 2 mM sodium azide-15, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LB1 Structure of the second domain of human Smurf1 in complex with a human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 220–233(14 aa) 片段:residues 221-233
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.420;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5ZOK Crystal structure of human SMAD1-MAN1 complex. 提交 2018-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 259–462(204 aa) 片段:UNP residues 259-462
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;293 K;0.1M MES, 10% PEG20,000
分辨率 2.85 Å R-free 0.255
5ZOK Crystal structure of human SMAD1-MAN1 complex. 提交 2018-04-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 259–462(204 aa) 片段:UNP residues 259-462
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;293 K;0.1M MES, 10% PEG20,000
分辨率 2.85 Å R-free 0.255