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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：Q1D3Y8 重新检索
3PDB条目
15Biological assembly
50链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7S4Q M. xanthus encapsulin EncA bound to EncC targeting peptide 提交 2021-09-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric（360） 与蛋白数一致
链 F 105–116（12 aa）
链 G 105–116（12 aa）
链 H 105–116（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；20 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7S4Q M. xanthus encapsulin EncA bound to EncC targeting peptide 提交 2021-09-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 F 105–116（12 aa）
链 G 105–116（12 aa）
链 H 105–116（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；20 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7S4Q M. xanthus encapsulin EncA bound to EncC targeting peptide 提交 2021-09-09 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致
链 F 105–116（12 aa）
链 G 105–116（12 aa）
链 H 105–116（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；20 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7S4Q M. xanthus encapsulin EncA bound to EncC targeting peptide 提交 2021-09-09 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致
链 F 105–116（12 aa）
链 G 105–116（12 aa）
链 H 105–116（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；20 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7S4Q M. xanthus encapsulin EncA bound to EncC targeting peptide 提交 2021-09-09 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 F 105–116（12 aa）
链 G 105–116（12 aa）
链 H 105–116（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3；20 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9B9Q Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=3 icosahedral symmetry 提交 2024-04-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric（360） 与蛋白数一致
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.14 Å
9B9Q Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=3 icosahedral symmetry 提交 2024-04-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.14 Å
9B9Q Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=3 icosahedral symmetry 提交 2024-04-03 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.14 Å
9B9Q Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=3 icosahedral symmetry 提交 2024-04-03 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.14 Å
9B9Q Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=3 icosahedral symmetry 提交 2024-04-03 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.14 Å
9BC8 Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=4 icosahedral symmetry 提交 2024-04-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 480 PDB 声明：480-meric（480） 与蛋白数一致
链 E 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.46 Å
9BC8 Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=4 icosahedral symmetry 提交 2024-04-08 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致
链 E 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.46 Å
9BC8 Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=4 icosahedral symmetry 提交 2024-04-08 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric（40） 与蛋白数一致
链 E 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.46 Å
9BC8 Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=4 icosahedral symmetry 提交 2024-04-08 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致
链 E 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.46 Å
9BC8 Cargo-loaded Myxococcus xanthus EncA encapsulin engineered pore mutant with T=4 icosahedral symmetry 提交 2024-04-08 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致
链 E 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 F 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 G 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
链 H 119–130（12 aa） 片段：C-terminal targeting peptide (UNP residues 119-130)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force: 20 Blot time: 4 seconds Wait time: 0 seconds
分辨率 3.46 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。