当前蛋白身份:Q1D4U9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2I6F Receiver domain from Myxococcus xanthus social motility protein FrzS 提交 2006-08-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–124(124 aa) 片段:Receiver domain (residues 1-124)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG 3350, NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
2I6F Receiver domain from Myxococcus xanthus social motility protein FrzS 提交 2006-08-28 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–124(124 aa) 片段:Receiver domain (residues 1-124)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG 3350, NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
2I6F Receiver domain from Myxococcus xanthus social motility protein FrzS 提交 2006-08-28 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–124(124 aa) 片段:Receiver domain (residues 1-124)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG 3350, NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 3–117(115 aa)
突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2
分辨率 2.44 Å R-free 0.235
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 3–117(115 aa)
突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2
分辨率 2.44 Å R-free 0.235
9QY8 Crystal structure of apoform human USP18 提交 2025-04-17 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–124(124 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20 % (w/v) PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.260
9QY8 Crystal structure of apoform human USP18 提交 2025-04-17 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–124(124 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20 % (w/v) PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.260