当前蛋白身份:Q24K09 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6PZV Crystal Structure of Bovine DNMT1 RFTS domain in complex with H3K9me3 and Ubiquitin 提交 2019-08-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 349–594(246 aa)
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.5;277 K;0.1M citric acid (pH 3.5), 28% PEG8000
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
6PZV Crystal Structure of Bovine DNMT1 RFTS domain in complex with H3K9me3 and Ubiquitin 提交 2019-08-01 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 349–594(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.5;277 K;0.1M citric acid (pH 3.5), 28% PEG8000
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 725–837(113 aa)
链 A 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 725–837(113 aa)
链 B 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 725–837(113 aa)
链 C 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 725–837(113 aa)
链 D 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 725–837(113 aa)
链 A 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 725–837(113 aa)
链 B 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 725–837(113 aa)
链 C 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 725–837(113 aa)
链 D 859–897(39 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267