当前蛋白身份:Q2FXB0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3ROH Crystal Structure of Leukotoxin (LukE) from Staphylococcus aureus subsp. aureus COL. 提交 2011-04-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–306(306 aa)
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;Protein: 7mG/mL, 0.25M Sodium chloride, 0.01M Tris, pH 8.3. Screen: JCSG+, D7, 0.2M Lithium sulfate, 0.1M Tris, pH 8.5, 40% v/v PEG 400. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.20 Å R-free 0.224
7P8S Crystal Structure of leukotoxin LukE from Staphylococcus aureus at 1.9 Angstrom resolution 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–306(300 aa)
未记录 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 MHA (CARBAMOYLMETHYL-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ACETIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.1 M Ammonium sulfate, 0.05 M Magnesium sulfate heptahydrate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5 and 22.5 % v/v PEG Smear Medium
分辨率 1.90 Å R-free 0.203
7P8T Crystal Structure of leukotoxin LukE from Staphylococcus aureus at 1.5 Angstrom resolution 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–306(300 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Imidazole.HCl pH 8.0, 30% (w/v) MPD, 10% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.46 Å R-free 0.194
7P8U Crystal Structure of leukotoxin LukE from Staphylococcus aureus in complex with p-cresyl sulfate 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–306(300 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 6EI (4-methylphenyl) hydrogen sulfate × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293.15 K;0.1 M Imidazole.HCl pH 8.0, 30% (w/v) MPD, 10% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.60 Å R-free 0.205
7P8X Crystal Structure of leukotoxin LukE from Staphylococcus aureus in complex with a doubly sulfated CCR2 N-terminal peptide 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 7–306(300 aa)
未记录 IMD IMIDAZOLE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293.15 K;0.1 M Imidazole.HCl pH 8.0, 30% (w/v) MPD, 10% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.40 Å R-free 0.198
7P93 Crystal Structure of leukotoxin LukE from Staphylococcus aureus in complex with a sulfated ACKR1 N-terminal peptide 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 7–306(300 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293.15 K;0.1 M Imidazole.HCl pH 8.0, 30% (w/v) MPD, 10% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.55 Å R-free 0.204