当前蛋白身份：Q2RRP5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7VWX CryoEM structure of football-shaped GroEL:ES2 with RuBisCO 提交 2021-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric（29） 与蛋白数一致 |
链 a
1–466（466 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.60 Å |
| 8BAA CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco, class II. 提交 2022-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 Z
1–466（466 aa）
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未记录 | AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).
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分辨率 4.20 Å |
| 9I26 inactive Form II Rubisco from Rhodospirillum rubrum 提交 2025-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–466（466 aa）
链 B
1–466（466 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；Inactive CbbM in 20 mM Tris buffer (pH 8.5), containing 100 mM NaCl was mixed with condition comprised of 1.2 M ammonium chloride, 100 mM MES (pH 6), 20 %(w/v) PEG6000 in a 1:1 ratio with a final drop volume of 1 micro liter. The mother liquor was supplemented with 30% (v/v) PEG200, before the crystals were plunge frozen in liquid nitrogen
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分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 9I27 activated Form II Rubisco from Rhodospirillum rubrum with bound Magnesium and CABP 提交 2025-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–466（466 aa）
链 B
1–466（466 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；289 K；Crystallization of activated CbbM in buffer containing 20 mM Tris (pH 8.5), 100 mM NaCl, 0.2 mM CABP, and 10 mM sodium bicarbonate was mixed with a condition containing 200 mM Bis-Tris propane (pH 7.3) and 20 % (w/v) PEG4000. Prior to plung freezing the crystals in liquid nitrogen the mother liquor was supplemented with 33 % (v/v) PEG200.
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分辨率 2.30 Å R-free 0.217 |
| 9I28 Form II Rubisco inside EPYC1-formed liquid-liquid phase separated condensates with bound Magnesium and CABP 提交 2025-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–466（466 aa）
链 B
1–466（466 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 s with blot force 20
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分辨率 2.93 Å |