当前蛋白身份：Q2YDS1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3EI1 Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 14 bp 6-4 photoproduct containing DNA-duplex 提交 2008-09-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
94–457（364 aa）
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；100mM Ca-Acetate, 100mM MES pH 5.7, 12-14 % PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 3EI2 Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 16 bp abasic site containing DNA-duplex 提交 2008-09-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
94–457（364 aa）
片段：residues (-8)-427
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；100mM Ca-Acetate, 100mM MES pH 5.7, 12-14% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.268 |
| 3EI3 Structure of the hsDDB1-drDDB2 complex 提交 2008-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
94–457（364 aa）
片段：residues 75-457
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；100mM Ca-Acetate, 100mM MES pH 5.7, 12-14% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.251 |
| 4A08 Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 13 bp CPD-duplex (purine at D-1 position) at 3.0 A resolution (CPD 1) 提交 2011-09-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
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未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；100 MM MES, 25 MM NAOH, 18% PEG 350MME., pH 5.6
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 4A09 Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 15 bp CPD-duplex (purine at D-1 position) at 3.1 A resolution (CPD 2) 提交 2011-09-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.3；100 MM MES, 15 MM NAOH, 21% PEG 200, pH 5.3
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.308 |
| 4A0A Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 16 bp CPD-duplex (pyrimidine at D-1 position) at 3.6 A resolution (CPD 3) 提交 2011-09-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；100 MM MES, 28 MM NAOH, 16% PEG 350MME., pH 5.6
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.347 |
| 4A0B Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 16 bp CPD-duplex (pyrimidine at D-1 position) at 3.8 A resolution (CPD 4) 提交 2011-09-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.3；100 MM MES, 15 MM NAOH, 18% PEG 350MME., pH 5.3
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.319 |
| 4A0B Structure of hsDDB1-drDDB2 bound to a 16 bp CPD-duplex (pyrimidine at D-1 position) at 3.8 A resolution (CPD 4) 提交 2011-09-08 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.3；100 MM MES, 15 MM NAOH, 18% PEG 350MME., pH 5.3
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.319 |
| 4A0K STRUCTURE OF DDB1-DDB2-CUL4A-RBX1 BOUND TO A 12 BP ABASIC SITE CONTAINING DNA-DUPLEX 提交 2011-09-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.3；100MM TRIS-HCL PH 8.3, 33% PEG 200
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分辨率 5.93 Å R-free 0.270 |
| 4A0L Structure of DDB1-DDB2-CUL4B-RBX1 bound to a 12 bp abasic site containing DNA-duplex 提交 2011-09-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；100MM MES PH 6.2, 3.1% PEG 6000, 4% ETHYLENEGLYCOL
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分辨率 7.40 Å R-free 0.320 |
| 4A0L Structure of DDB1-DDB2-CUL4B-RBX1 bound to a 12 bp abasic site containing DNA-duplex 提交 2011-09-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
60–423（364 aa）
片段：RESIDUES 60-423
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；100MM MES PH 6.2, 3.1% PEG 6000, 4% ETHYLENEGLYCOL
|
分辨率 7.40 Å R-free 0.320 |