当前蛋白身份：Q3UP24
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JBL Cryo-EM Structure of the Activated NAIP2/NLRC4 Inflammasome Reveals Nucleated Polymerization 提交 2015-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 B
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 C
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 D
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 E
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 F
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 G
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 H
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 I
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 J
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
链 K
93–1024（932 aa）
片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 2 mM DTT；pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
Blot for one second before plunging；103 K；冷冻剂 ETHANE；Blotted for one second before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
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分辨率 4.70 Å R-free 0.383 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1024（1024 aa）
链 F
1–1024（1024 aa）
链 H
1–1024（1024 aa）
链 L
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 11 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–1024（1024 aa）
链 N
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 N
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 P
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 4KXF Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism 提交 2013-05-25 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–1024（1024 aa）
链 P
1–1024（1024 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 5AJ2 Cryo electron tomography of the Naip5-Nlrc4 inflammasome 提交 2015-02-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–355（355 aa）
片段：RESIDUES 1-355
链 B
356–580（225 aa）
片段：RESIDUES 356-580
链 C
580–1024（445 aa）
片段：RESIDUES 580-1024
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
100 MM NACL, 20 MM HEPES, 2MM BENZAMIDIN, 2MM DTT；pH 7.5；100 MM NACL, 20 MM HEPES, 2MM BENZAMIDIN, 2MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- LEICA EM GP, METHOD- 3 SECONDS BLOTTING,
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分辨率 40.00 Å |
| 6B5B Cryo-EM structure of the NAIP5-NLRC4-flagellin inflammasome 提交 2017-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å |