当前蛋白身份:Q49A26 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4GUR Crystal structure of LSD2-NPAC with H3 in space group P21 提交 2012-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 152–268(117 aa) 片段:UNP residues 152-268
未记录 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.02M Citric acid, 0.03M Bis_tris propane, 10% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.204
4GUS Crystal structure of LSD2-NPAC with H3 in space group P3221 提交 2012-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 152–268(117 aa) 片段:UNP residues 152-268
未记录 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 IOD IODIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;277 K;0.1M Ammonium Iodide, 0.1M MES, 10% PEG3350, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.23 Å R-free 0.237
4GUT Crystal structure of LSD2-NPAC 提交 2012-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 152–268(117 aa) 片段:UNP residues 152-268
未记录 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.02M Citric acid, 0.03M Bis_tris propane, 10% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.207
4GUU Crystal structure of LSD2-NPAC with tranylcypromine 提交 2012-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 152–268(117 aa) 片段:UNP residues 152-268
未记录 FA9 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(3R,3aS,7aR)-10,11-dimethyl-1,4,6-trioxo-3-phenyl-2,3,5,6,7,7a-hexahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.02M Citric acid, 0.03M Bis_tris propane, 10% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.231
4HSU Crystal structure of LSD2-NPAC with H3(1-26)in space group P21 提交 2012-10-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 152–268(117 aa) 片段:UNP residues 152-268
未记录 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.02M Citric acid, 0.03M Bis_tris propane, 10% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.99 Å R-free 0.232
6R1U Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 2 提交 2019-03-15 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 L 152–268(117 aa)
未记录 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å