当前蛋白身份：Q4U5Z6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6KVM Crystal structure of Chicken MHC Class II for 1.9 angstrom 提交 2019-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
24–217（194 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 4000, 100mM Tris base/Hydrochloric acid pH 8.5, 200mM Lithium sulfate
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分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 6T3Y Improved High Resolution Structure of MHC Class II complex 提交 2019-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–207（181 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Na Acetate
0.1 M TRIS
30 %w/v PEG 4K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 6ZWA CLIP peptide bound to chicken MHC class II molecule (BL-2) from B19 haplotype 提交 2020-07-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–207（181 aa）
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 20.0% w/v PEG 4000, 200mM CaCl2
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分辨率 1.68 Å R-free 0.252 |
| 7APZ CLIP peptide bound to chicken MHC class II molecule (BL-2) from B2 haplotype with a decamer mode of binding 提交 2020-10-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
27–207（181 aa）
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 4 ACE ACETYL GROUP × 20 ZN ZINC ION × 20 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NI NICKEL (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Zinc Acetate (Salt)
0.1 M Imidazole pH 6.5 (Buffer)
10 %w/v PEG 8000 (Precipitant)
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分辨率 1.97 Å R-free 0.255 |
| 7PDY A viral peptide from Marek's disease virus bound to chicken MHC-II molecule 提交 2021-08-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–214（188 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 4000, sodium acetate
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分辨率 2.54 Å R-free 0.252 |
| 7PDY A viral peptide from Marek's disease virus bound to chicken MHC-II molecule 提交 2021-08-09 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
27–214（188 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 4000, sodium acetate
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.252 |
| 7PDY A viral peptide from Marek's disease virus bound to chicken MHC-II molecule 提交 2021-08-09 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
27–214（188 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；PEG 4000, sodium acetate
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分辨率 2.54 Å R-free 0.252 |