当前蛋白身份：Q4VCS5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6JJX Crystal Structure of KIBRA and Angiomotin complex 提交 2019-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
272–293（22 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% w/v pentaerythritol propoxylat 629 (17/8 PO/OH), 50mM MgCl2, 100mM Tris (pH 8.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 6JJX Crystal Structure of KIBRA and Angiomotin complex 提交 2019-02-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
272–293（22 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% w/v pentaerythritol propoxylat 629 (17/8 PO/OH), 50mM MgCl2, 100mM Tris (pH 8.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 7LP2 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
233–247（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；2.0M Ammonium Sulfate, 0.1M BIS-TRIS
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 7LP2 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
233–247（15 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；2.0M Ammonium Sulfate, 0.1M BIS-TRIS
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 7LP2 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
233–247（15 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；2.0M Ammonium Sulfate, 0.1M BIS-TRIS
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 7LP3 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
234–247（14 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；1.6M (NH4)2SO4, 0.1M Potassium Sodium Tartrate, 5% glycerol, 0.1M Sodium Acetate
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分辨率 1.61 Å R-free 0.210 |
| 7LP3 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
234–247（14 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；310 K；1.6M (NH4)2SO4, 0.1M Potassium Sodium Tartrate, 5% glycerol, 0.1M Sodium Acetate
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.210 |
| 7LP5 Structure of Nedd4L WW3 domain 提交 2021-02-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
100–114（15 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Angiomotin,E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like fusion, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] Angiomotin,E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like fusion, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 7NMA Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
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分辨率 1.75 Å R-free 0.220 |
| 7NMW Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide and fragment 40 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UJW 5-(2-azanylethyl)-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.180 |
| 7NMX Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide and fragment 12 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K7Q ~{N}-(2-azanylethyl)-2-carbamimidoyl-7-methoxy-1-benzothiophene-4-carboxamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol.
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分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 7NN2 Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide and fragment 41 提交 2021-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K8W 7-(6-azanyl-5-methyl-pyridin-2-yl)-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.192 |
| 7NND Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide and fragment 09 提交 2021-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 K7N 5-[1-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.172 |
| 7NNE Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 13mer Amot-p130 peptide and fragment 22 提交 2021-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K92 5-[3-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.260 |
| 7NP2 Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 20mer Amot-p130 peptide 提交 2021-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–188（20 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.181 |
| 7NPB Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 20mer Amot-p130 peptide and fragment 09 提交 2021-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–188（20 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K7N 5-[1-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.179 |
| 7NPG Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with 20mer Amot-p130 peptide and fragment 22 提交 2021-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–188（20 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K92 5-[3-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5% Glycerol
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.171 |
| 7OQG Ternary complex of 14-3-3 sigma, Amot-p130 phosphopeptide, and WQ136 提交 2021-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0AW ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-carboxamide × 6 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5% Glycerol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.178 |
| 7OQJ Ternary complex of 14-3-3 sigma, Amot-p130 phosphopeptide, and WQ162 提交 2021-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 09W ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 6 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH 7.5, 26% PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5% Glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.201 |
| 7OQS Ternary complex of 14-3-3 sigma, Amot-p130 phosphopeptide, and WQ177 提交 2021-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0BS 2-(1,3-benzodioxol-5-yl)-~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.5, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
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分辨率 1.34 Å R-free 0.195 |
| 7OQU Ternary complex of 14-3-3 sigma, Amot-p130 phosphopeptide, and WQ180 提交 2021-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0BL (2~{S},3~{S})-~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-3-methyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.5, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |
| 7OQW Ternary complex of 14-3-3 sigma, Amot-p130 phosphopeptide, and WQ178 提交 2021-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
169–181（13 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0B7 ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-1~{H}-indole-6-carboxamide × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.5, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |