当前蛋白身份:Q58T34 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5YYS Cryo-EM structure of L-fucokinase, GDP-fucose pyrophosphorylase (FKP)in Bacteroides fragilis 提交 2017-12-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–949(949 aa)
链 B 1–949(949 aa)
链 C 1–949(949 aa)
链 D 1–949(949 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9IIP Fucokinase part of FKP with beta-L-fucose 1-phosphate 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 531–949(419 aa) 片段:fucokinase part
未记录 ED6 6-deoxy-1-O-phosphono-beta-L-galactopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;PEG 3350, Trypton, HEPES, beta-L-fucose 1-phosphate, MnCl2
分辨率 2.45 Å R-free 0.217
9IIS GDP-fucose pyrophosphorylase part of FKP with a SUMO tag 提交 2024-06-21 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–496(496 aa)
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;PEG 3350, ammonium acetate, HEPES
分辨率 2.36 Å R-free 0.254
9IIT Full length structure of FKP in complex with GTP and GDP 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–949(949 aa)
链 B 1–949(949 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 FMT FORMIC ACID × 4 MLA MALONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;8% Tascimate, 20% PEG 3350, 15mM GTP, 15mM MgCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.232