当前蛋白身份:Q5HHB9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4WVG Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB). 提交 2014-11-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–191(166 aa) 片段:UNP RESIDUES 33-393, UNP RESIDUES 26-191
突变:S36A, R393N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 0.2 M amino acids mix (0.2 M sodium-L-glutamate, 0.2 M DL-alanine, 0.2 M glycine, 0.2 M DL-lysine, 0.2 M DL-serine), 100 mM Tris.Cl pH 8.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.242
4WVH Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep1). 提交 2014-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 26–175(150 aa) 片段:unp residues 33-382, unp reisdues 26-175
突变:K143G, Q78C,K143G, Q78C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE;296 K;12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.248
4WVI Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep2). 提交 2014-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 26–175(150 aa) 片段:unp residues 33-393, unp residues 26-175
突变:K143G, Q78C, R393N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE;290 K;12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.219
4WVJ Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with an inhibitor peptide (pep3). 提交 2014-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 26–175(150 aa) 片段:UNP RESIDUES 33-393, unp residues 26-175
突变:K143G, Q78C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE;290 K;12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.229