当前蛋白身份:Q5M4D0 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
10LG Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 in complex with Rgg3bp13 提交 2026-01-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–284(284 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;293 K;100 mM sodium citrate pH 5.2, 300 mM Na/K tartrate, and 1.4 M ammonium sulfate
分辨率 1.87 Å R-free 0.218
6W1E Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 提交 2020-03-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–284(284 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.2;298 K;100 mM sodium citrate, 300 mM Na/K tartrate, and 1.4 M ammonium sulfate
分辨率 2.20 Å R-free 0.309
6W1F Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 bound to DNA 提交 2020-03-04 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–284(284 aa)
链 B 1–284(284 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;298 K;170 mM ammonium acetate, 85 mM sodium citrate, 22% PEG 4,000, and 15% glycerol
分辨率 3.20 Å R-free 0.266
7JI0 CryoEM structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 in complex with SHP3 提交 2020-07-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–284(284 aa)
链 B 1–284(284 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;2.5 microliters Rgg3St-SHP3 was applied to glow-discharged UltraAuFoil (1.2/1.3) 300-mesh grids (Quantifoil), blotted with filter paper for 3-3.5 s, and flash-frozen by plunging in liquid ethane cooled with liquid nitrogen. Grids were stored in liquid nitrogen.
分辨率 2.95 Å