当前蛋白身份:Q5M4D0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10LG Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 in complex with Rgg3bp13 提交 2026-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–284(284 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;293 K;100 mM sodium citrate pH 5.2, 300 mM Na/K tartrate, and 1.4 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.218 |
| 6W1E Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 提交 2020-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–284(284 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.2;298 K;100 mM sodium citrate, 300 mM Na/K tartrate, and 1.4 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.309 |
| 6W1F Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 bound to DNA 提交 2020-03-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–284(284 aa)
链 B
1–284(284 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;298 K;170 mM ammonium acetate, 85 mM sodium citrate, 22% PEG 4,000, and 15% glycerol
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 7JI0 CryoEM structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 in complex with SHP3 提交 2020-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–284(284 aa)
链 B
1–284(284 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;2.5 microliters Rgg3St-SHP3 was applied to glow-discharged UltraAuFoil (1.2/1.3) 300-mesh grids (Quantifoil), blotted with filter paper for 3-3.5 s, and flash-frozen by plunging in liquid ethane cooled with liquid nitrogen. Grids were stored in liquid nitrogen.
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分辨率 2.95 Å |